Protein–RNA interactions for Protein: P43687

Hmx2, Homeobox protein HMX2, mousemouse

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmx2P43687 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hmx2P43687 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hmx2P43687 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hmx2P43687 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hmx2P43687 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hmx2P43687 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hmx2P43687 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hmx2P43687 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hmx2P43687 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hmx2P43687 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hmx2P43687 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hmx2P43687 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hmx2P43687 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hmx2P43687 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hmx2P43687 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hmx2P43687 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hmx2P43687 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hmx2P43687 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hmx2P43687 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hmx2P43687 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hmx2P43687 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hmx2P43687 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hmx2P43687 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hmx2P43687 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hmx2P43687 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hmx2P43687 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hmx2P43687 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hmx2P43687 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hmx2P43687 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hmx2P43687 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hmx2P43687 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hmx2P43687 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hmx2P43687 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hmx2P43687 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hmx2P43687 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hmx2P43687 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hmx2P43687 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hmx2P43687 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hmx2P43687 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hmx2P43687 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Hmx2P43687 Gm17872-201ENSMUST00000222550 532 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Hmx2P43687 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hmx2P43687 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hmx2P43687 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hmx2P43687 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hmx2P43687 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hmx2P43687 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hmx2P43687 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hmx2P43687 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hmx2P43687 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hmx2P43687 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hmx2P43687 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hmx2P43687 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hmx2P43687 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hmx2P43687 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hmx2P43687 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hmx2P43687 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hmx2P43687 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hmx2P43687 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hmx2P43687 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hmx2P43687 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hmx2P43687 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hmx2P43687 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hmx2P43687 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hmx2P43687 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hmx2P43687 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hmx2P43687 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hmx2P43687 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hmx2P43687 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hmx2P43687 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hmx2P43687 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hmx2P43687 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hmx2P43687 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Hmx2P43687 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Hmx2P43687 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hmx2P43687 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Hmx2P43687 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hmx2P43687 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hmx2P43687 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hmx2P43687 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hmx2P43687 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hmx2P43687 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hmx2P43687 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hmx2P43687 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hmx2P43687 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hmx2P43687 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hmx2P43687 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hmx2P43687 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hmx2P43687 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hmx2P43687 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hmx2P43687 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hmx2P43687 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hmx2P43687 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hmx2P43687 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hmx2P43687 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hmx2P43687 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hmx2P43687 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hmx2P43687 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hmx2P43687 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hmx2P43687 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms