Protein–RNA interactions for Protein: P43117

Ptgfr, Prostaglandin F2-alpha receptor, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtgfrP43117 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
PtgfrP43117 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
PtgfrP43117 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
PtgfrP43117 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
PtgfrP43117 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PtgfrP43117 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PtgfrP43117 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PtgfrP43117 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PtgfrP43117 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PtgfrP43117 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PtgfrP43117 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PtgfrP43117 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PtgfrP43117 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PtgfrP43117 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PtgfrP43117 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PtgfrP43117 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PtgfrP43117 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
PtgfrP43117 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PtgfrP43117 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PtgfrP43117 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PtgfrP43117 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PtgfrP43117 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PtgfrP43117 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PtgfrP43117 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PtgfrP43117 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PtgfrP43117 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PtgfrP43117 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PtgfrP43117 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PtgfrP43117 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PtgfrP43117 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PtgfrP43117 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PtgfrP43117 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PtgfrP43117 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PtgfrP43117 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PtgfrP43117 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PtgfrP43117 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PtgfrP43117 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PtgfrP43117 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PtgfrP43117 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PtgfrP43117 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
PtgfrP43117 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PtgfrP43117 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PtgfrP43117 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PtgfrP43117 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PtgfrP43117 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PtgfrP43117 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PtgfrP43117 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
PtgfrP43117 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PtgfrP43117 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PtgfrP43117 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PtgfrP43117 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PtgfrP43117 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PtgfrP43117 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PtgfrP43117 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PtgfrP43117 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PtgfrP43117 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PtgfrP43117 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PtgfrP43117 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PtgfrP43117 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PtgfrP43117 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PtgfrP43117 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PtgfrP43117 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PtgfrP43117 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PtgfrP43117 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PtgfrP43117 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PtgfrP43117 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PtgfrP43117 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PtgfrP43117 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PtgfrP43117 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PtgfrP43117 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PtgfrP43117 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PtgfrP43117 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PtgfrP43117 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PtgfrP43117 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PtgfrP43117 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PtgfrP43117 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PtgfrP43117 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PtgfrP43117 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PtgfrP43117 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PtgfrP43117 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PtgfrP43117 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PtgfrP43117 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PtgfrP43117 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PtgfrP43117 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PtgfrP43117 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PtgfrP43117 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
PtgfrP43117 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PtgfrP43117 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PtgfrP43117 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PtgfrP43117 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PtgfrP43117 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PtgfrP43117 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PtgfrP43117 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PtgfrP43117 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PtgfrP43117 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PtgfrP43117 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PtgfrP43117 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PtgfrP43117 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PtgfrP43117 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
PtgfrP43117 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms