Protein–RNA interactions for Protein: P41539

Tac1, Protachykinin-1, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tac1P41539 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tac1P41539 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tac1P41539 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tac1P41539 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Tac1P41539 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Tac1P41539 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tac1P41539 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tac1P41539 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tac1P41539 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tac1P41539 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Tac1P41539 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tac1P41539 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tac1P41539 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Tac1P41539 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tac1P41539 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tac1P41539 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tac1P41539 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tac1P41539 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tac1P41539 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Tac1P41539 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tac1P41539 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Tac1P41539 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tac1P41539 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tac1P41539 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tac1P41539 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tac1P41539 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tac1P41539 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tac1P41539 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tac1P41539 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tac1P41539 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tac1P41539 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tac1P41539 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tac1P41539 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Tac1P41539 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tac1P41539 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tac1P41539 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tac1P41539 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tac1P41539 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Tac1P41539 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tac1P41539 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tac1P41539 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tac1P41539 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tac1P41539 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tac1P41539 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tac1P41539 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tac1P41539 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tac1P41539 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tac1P41539 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tac1P41539 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tac1P41539 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tac1P41539 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tac1P41539 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tac1P41539 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tac1P41539 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tac1P41539 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tac1P41539 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tac1P41539 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tac1P41539 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tac1P41539 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tac1P41539 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tac1P41539 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tac1P41539 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tac1P41539 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tac1P41539 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tac1P41539 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tac1P41539 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tac1P41539 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tac1P41539 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tac1P41539 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tac1P41539 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tac1P41539 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tac1P41539 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tac1P41539 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tac1P41539 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tac1P41539 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tac1P41539 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tac1P41539 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tac1P41539 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tac1P41539 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tac1P41539 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tac1P41539 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tac1P41539 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tac1P41539 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tac1P41539 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tac1P41539 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tac1P41539 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tac1P41539 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tac1P41539 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tac1P41539 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tac1P41539 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Tac1P41539 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tac1P41539 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tac1P41539 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tac1P41539 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tac1P41539 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tac1P41539 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tac1P41539 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tac1P41539 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tac1P41539 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Tac1P41539 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms