Protein–RNA interactions for Protein: P41155

Ltb, Lymphotoxin-beta, mousemouse

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Length 306 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbP41155 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
LtbP41155 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
LtbP41155 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
LtbP41155 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
LtbP41155 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
LtbP41155 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
LtbP41155 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
LtbP41155 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
LtbP41155 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
LtbP41155 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
LtbP41155 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
LtbP41155 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
LtbP41155 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
LtbP41155 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
LtbP41155 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
LtbP41155 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
LtbP41155 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
LtbP41155 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
LtbP41155 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
LtbP41155 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
LtbP41155 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
LtbP41155 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
LtbP41155 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
LtbP41155 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
LtbP41155 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
LtbP41155 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
LtbP41155 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
LtbP41155 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
LtbP41155 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
LtbP41155 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
LtbP41155 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
LtbP41155 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
LtbP41155 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
LtbP41155 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
LtbP41155 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
LtbP41155 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
LtbP41155 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
LtbP41155 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
LtbP41155 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
LtbP41155 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
LtbP41155 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
LtbP41155 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
LtbP41155 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
LtbP41155 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
LtbP41155 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
LtbP41155 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
LtbP41155 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
LtbP41155 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
LtbP41155 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
LtbP41155 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
LtbP41155 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
LtbP41155 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
LtbP41155 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
LtbP41155 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
LtbP41155 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
LtbP41155 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
LtbP41155 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
LtbP41155 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
LtbP41155 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
LtbP41155 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
LtbP41155 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LtbP41155 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LtbP41155 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LtbP41155 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LtbP41155 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LtbP41155 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LtbP41155 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LtbP41155 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LtbP41155 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LtbP41155 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LtbP41155 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LtbP41155 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LtbP41155 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LtbP41155 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
LtbP41155 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
LtbP41155 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LtbP41155 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LtbP41155 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
LtbP41155 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
LtbP41155 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
LtbP41155 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LtbP41155 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LtbP41155 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LtbP41155 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LtbP41155 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LtbP41155 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LtbP41155 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LtbP41155 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
LtbP41155 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LtbP41155 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LtbP41155 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LtbP41155 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
LtbP41155 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
LtbP41155 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
LtbP41155 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LtbP41155 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LtbP41155 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LtbP41155 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LtbP41155 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LtbP41155 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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