Protein–RNA interactions for Protein: P40336

Vps26a, Vacuolar protein sorting-associated protein 26A, mousemouse

Predictions only

Length 327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps26aP40336 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vps26aP40336 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vps26aP40336 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vps26aP40336 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vps26aP40336 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vps26aP40336 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vps26aP40336 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vps26aP40336 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vps26aP40336 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Vps26aP40336 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vps26aP40336 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vps26aP40336 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vps26aP40336 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vps26aP40336 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vps26aP40336 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Vps26aP40336 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vps26aP40336 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vps26aP40336 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vps26aP40336 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vps26aP40336 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vps26aP40336 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vps26aP40336 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vps26aP40336 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vps26aP40336 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vps26aP40336 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vps26aP40336 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vps26aP40336 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vps26aP40336 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vps26aP40336 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vps26aP40336 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vps26aP40336 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vps26aP40336 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vps26aP40336 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vps26aP40336 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vps26aP40336 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vps26aP40336 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vps26aP40336 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vps26aP40336 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vps26aP40336 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vps26aP40336 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vps26aP40336 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vps26aP40336 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vps26aP40336 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Vps26aP40336 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vps26aP40336 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vps26aP40336 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vps26aP40336 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vps26aP40336 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vps26aP40336 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vps26aP40336 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vps26aP40336 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vps26aP40336 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vps26aP40336 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vps26aP40336 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vps26aP40336 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vps26aP40336 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vps26aP40336 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vps26aP40336 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vps26aP40336 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vps26aP40336 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vps26aP40336 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vps26aP40336 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vps26aP40336 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vps26aP40336 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vps26aP40336 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vps26aP40336 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vps26aP40336 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Vps26aP40336 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vps26aP40336 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vps26aP40336 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vps26aP40336 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Vps26aP40336 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vps26aP40336 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vps26aP40336 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vps26aP40336 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vps26aP40336 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vps26aP40336 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vps26aP40336 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vps26aP40336 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vps26aP40336 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vps26aP40336 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vps26aP40336 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vps26aP40336 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vps26aP40336 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vps26aP40336 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vps26aP40336 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vps26aP40336 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vps26aP40336 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vps26aP40336 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vps26aP40336 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vps26aP40336 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vps26aP40336 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vps26aP40336 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vps26aP40336 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vps26aP40336 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vps26aP40336 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vps26aP40336 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vps26aP40336 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vps26aP40336 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vps26aP40336 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms