Protein–RNA interactions for Protein: P35821

Ptpn1, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 1, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn1P35821 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptpn1P35821 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptpn1P35821 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptpn1P35821 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptpn1P35821 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptpn1P35821 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptpn1P35821 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptpn1P35821 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptpn1P35821 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptpn1P35821 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptpn1P35821 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptpn1P35821 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptpn1P35821 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptpn1P35821 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptpn1P35821 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptpn1P35821 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptpn1P35821 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptpn1P35821 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptpn1P35821 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptpn1P35821 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptpn1P35821 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptpn1P35821 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptpn1P35821 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptpn1P35821 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptpn1P35821 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptpn1P35821 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptpn1P35821 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptpn1P35821 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptpn1P35821 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptpn1P35821 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptpn1P35821 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptpn1P35821 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptpn1P35821 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptpn1P35821 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptpn1P35821 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptpn1P35821 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptpn1P35821 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptpn1P35821 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptpn1P35821 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptpn1P35821 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptpn1P35821 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptpn1P35821 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptpn1P35821 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptpn1P35821 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptpn1P35821 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptpn1P35821 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptpn1P35821 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptpn1P35821 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptpn1P35821 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptpn1P35821 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptpn1P35821 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptpn1P35821 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptpn1P35821 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptpn1P35821 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptpn1P35821 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptpn1P35821 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptpn1P35821 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptpn1P35821 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptpn1P35821 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptpn1P35821 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptpn1P35821 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptpn1P35821 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptpn1P35821 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptpn1P35821 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptpn1P35821 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptpn1P35821 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptpn1P35821 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ptpn1P35821 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ptpn1P35821 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ptpn1P35821 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ptpn1P35821 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ptpn1P35821 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ptpn1P35821 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ptpn1P35821 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ptpn1P35821 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ptpn1P35821 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ptpn1P35821 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ptpn1P35821 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ptpn1P35821 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ptpn1P35821 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ptpn1P35821 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ptpn1P35821 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ptpn1P35821 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ptpn1P35821 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ptpn1P35821 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ptpn1P35821 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ptpn1P35821 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ptpn1P35821 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ptpn1P35821 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ptpn1P35821 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ptpn1P35821 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ptpn1P35821 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ptpn1P35821 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ptpn1P35821 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ptpn1P35821 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ptpn1P35821 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ptpn1P35821 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ptpn1P35821 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ptpn1P35821 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ptpn1P35821 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms