Protein–RNA interactions for Protein: P35689

Ercc5, DNA repair protein complementing XP-G cells homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc5P35689 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ercc5P35689 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ercc5P35689 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ercc5P35689 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ercc5P35689 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ercc5P35689 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ercc5P35689 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ercc5P35689 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ercc5P35689 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ercc5P35689 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ercc5P35689 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ercc5P35689 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ercc5P35689 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ercc5P35689 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ercc5P35689 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ercc5P35689 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ercc5P35689 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ercc5P35689 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ercc5P35689 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ercc5P35689 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ercc5P35689 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ercc5P35689 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ercc5P35689 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Ercc5P35689 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Ercc5P35689 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ercc5P35689 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ercc5P35689 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Ercc5P35689 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ercc5P35689 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ercc5P35689 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ercc5P35689 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ercc5P35689 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ercc5P35689 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ercc5P35689 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ercc5P35689 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ercc5P35689 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ercc5P35689 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ercc5P35689 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ercc5P35689 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ercc5P35689 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ercc5P35689 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ercc5P35689 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ercc5P35689 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Ercc5P35689 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ercc5P35689 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Ercc5P35689 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ercc5P35689 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ercc5P35689 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ercc5P35689 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ercc5P35689 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ercc5P35689 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ercc5P35689 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ercc5P35689 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ercc5P35689 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ercc5P35689 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ercc5P35689 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ercc5P35689 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ercc5P35689 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ercc5P35689 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Ercc5P35689 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ercc5P35689 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ercc5P35689 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ercc5P35689 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ercc5P35689 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Ercc5P35689 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Ercc5P35689 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ercc5P35689 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Ercc5P35689 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Ercc5P35689 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ercc5P35689 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ercc5P35689 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ercc5P35689 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ercc5P35689 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ercc5P35689 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ercc5P35689 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ercc5P35689 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ercc5P35689 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ercc5P35689 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ercc5P35689 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ercc5P35689 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ercc5P35689 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ercc5P35689 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ercc5P35689 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ercc5P35689 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ercc5P35689 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ercc5P35689 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ercc5P35689 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ercc5P35689 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ercc5P35689 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ercc5P35689 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Ercc5P35689 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ercc5P35689 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ercc5P35689 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ercc5P35689 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Ercc5P35689 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Ercc5P35689 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ercc5P35689 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ercc5P35689 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Ercc5P35689 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ercc5P35689 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms