Protein–RNA interactions for Protein: P35375

Ptger1, Prostaglandin E2 receptor EP1 subtype, mousemouse

Predictions only

Length 405 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptger1P35375 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptger1P35375 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptger1P35375 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptger1P35375 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptger1P35375 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptger1P35375 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptger1P35375 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ptger1P35375 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ptger1P35375 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ptger1P35375 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ptger1P35375 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ptger1P35375 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ptger1P35375 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ptger1P35375 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ptger1P35375 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ptger1P35375 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ptger1P35375 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ptger1P35375 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ptger1P35375 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ptger1P35375 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ptger1P35375 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ptger1P35375 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ptger1P35375 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ptger1P35375 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ptger1P35375 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ptger1P35375 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ptger1P35375 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ptger1P35375 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ptger1P35375 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ptger1P35375 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ptger1P35375 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ptger1P35375 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ptger1P35375 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ptger1P35375 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ptger1P35375 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ptger1P35375 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ptger1P35375 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ptger1P35375 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ptger1P35375 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ptger1P35375 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ptger1P35375 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ptger1P35375 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ptger1P35375 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ptger1P35375 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ptger1P35375 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ptger1P35375 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ptger1P35375 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ptger1P35375 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ptger1P35375 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ptger1P35375 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ptger1P35375 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ptger1P35375 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ptger1P35375 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ptger1P35375 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ptger1P35375 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptger1P35375 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptger1P35375 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptger1P35375 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptger1P35375 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptger1P35375 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptger1P35375 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptger1P35375 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptger1P35375 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptger1P35375 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptger1P35375 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptger1P35375 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptger1P35375 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptger1P35375 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptger1P35375 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptger1P35375 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptger1P35375 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptger1P35375 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptger1P35375 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptger1P35375 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptger1P35375 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptger1P35375 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptger1P35375 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptger1P35375 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptger1P35375 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptger1P35375 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptger1P35375 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptger1P35375 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptger1P35375 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptger1P35375 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptger1P35375 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptger1P35375 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptger1P35375 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptger1P35375 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptger1P35375 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptger1P35375 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptger1P35375 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptger1P35375 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptger1P35375 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptger1P35375 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptger1P35375 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptger1P35375 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptger1P35375 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptger1P35375 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptger1P35375 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptger1P35375 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.6 ms