Protein–RNA interactions for Protein: P35235

Ptpn11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, mousemouse

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn11P35235 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ptpn11P35235 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ptpn11P35235 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ptpn11P35235 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Ptpn11P35235 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ptpn11P35235 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ptpn11P35235 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ptpn11P35235 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ptpn11P35235 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ptpn11P35235 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ptpn11P35235 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ptpn11P35235 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ptpn11P35235 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ptpn11P35235 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ptpn11P35235 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ptpn11P35235 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ptpn11P35235 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ptpn11P35235 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ptpn11P35235 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ptpn11P35235 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ptpn11P35235 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ptpn11P35235 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ptpn11P35235 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ptpn11P35235 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ptpn11P35235 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ptpn11P35235 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ptpn11P35235 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ptpn11P35235 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ptpn11P35235 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ptpn11P35235 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ptpn11P35235 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ptpn11P35235 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ptpn11P35235 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ptpn11P35235 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ptpn11P35235 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ptpn11P35235 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ptpn11P35235 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ptpn11P35235 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ptpn11P35235 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ptpn11P35235 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ptpn11P35235 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ptpn11P35235 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ptpn11P35235 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ptpn11P35235 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ptpn11P35235 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ptpn11P35235 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ptpn11P35235 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ptpn11P35235 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ptpn11P35235 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ptpn11P35235 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ptpn11P35235 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ptpn11P35235 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ptpn11P35235 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ptpn11P35235 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ptpn11P35235 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ptpn11P35235 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ptpn11P35235 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ptpn11P35235 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ptpn11P35235 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ptpn11P35235 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ptpn11P35235 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ptpn11P35235 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ptpn11P35235 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ptpn11P35235 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ptpn11P35235 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ptpn11P35235 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ptpn11P35235 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ptpn11P35235 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ptpn11P35235 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ptpn11P35235 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ptpn11P35235 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ptpn11P35235 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ptpn11P35235 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ptpn11P35235 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ptpn11P35235 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ptpn11P35235 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ptpn11P35235 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ptpn11P35235 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ptpn11P35235 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ptpn11P35235 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ptpn11P35235 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ptpn11P35235 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ptpn11P35235 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ptpn11P35235 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ptpn11P35235 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ptpn11P35235 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ptpn11P35235 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ptpn11P35235 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ptpn11P35235 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ptpn11P35235 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ptpn11P35235 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ptpn11P35235 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ptpn11P35235 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ptpn11P35235 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ptpn11P35235 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ptpn11P35235 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ptpn11P35235 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ptpn11P35235 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ptpn11P35235 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ptpn11P35235 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms