Protein–RNA interactions for Protein: P33610

Prim2, DNA primase large subunit, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prim2P33610 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prim2P33610 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prim2P33610 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prim2P33610 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prim2P33610 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prim2P33610 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prim2P33610 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prim2P33610 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prim2P33610 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prim2P33610 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prim2P33610 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prim2P33610 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prim2P33610 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prim2P33610 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prim2P33610 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Prim2P33610 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prim2P33610 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prim2P33610 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prim2P33610 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Prim2P33610 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Prim2P33610 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Prim2P33610 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Prim2P33610 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Prim2P33610 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prim2P33610 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prim2P33610 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prim2P33610 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prim2P33610 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Prim2P33610 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Prim2P33610 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prim2P33610 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prim2P33610 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prim2P33610 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prim2P33610 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prim2P33610 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prim2P33610 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prim2P33610 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prim2P33610 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prim2P33610 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Prim2P33610 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prim2P33610 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prim2P33610 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prim2P33610 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prim2P33610 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prim2P33610 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prim2P33610 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prim2P33610 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prim2P33610 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prim2P33610 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prim2P33610 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prim2P33610 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prim2P33610 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prim2P33610 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prim2P33610 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prim2P33610 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prim2P33610 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prim2P33610 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prim2P33610 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prim2P33610 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prim2P33610 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Prim2P33610 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prim2P33610 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Prim2P33610 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prim2P33610 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prim2P33610 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prim2P33610 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prim2P33610 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prim2P33610 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prim2P33610 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prim2P33610 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prim2P33610 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prim2P33610 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prim2P33610 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prim2P33610 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prim2P33610 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prim2P33610 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prim2P33610 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prim2P33610 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prim2P33610 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prim2P33610 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Prim2P33610 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prim2P33610 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prim2P33610 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prim2P33610 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prim2P33610 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Prim2P33610 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prim2P33610 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Prim2P33610 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prim2P33610 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prim2P33610 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prim2P33610 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prim2P33610 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prim2P33610 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prim2P33610 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prim2P33610 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prim2P33610 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prim2P33610 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prim2P33610 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prim2P33610 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prim2P33610 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms