Protein–RNA interactions for Protein: P33609

Pola1, DNA polymerase alpha catalytic subunit, mousemouse

Predictions only

Length 1,465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pola1P33609 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pola1P33609 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pola1P33609 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Pola1P33609 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Pola1P33609 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Pola1P33609 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pola1P33609 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pola1P33609 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pola1P33609 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pola1P33609 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Pola1P33609 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pola1P33609 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Pola1P33609 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pola1P33609 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pola1P33609 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pola1P33609 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pola1P33609 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Pola1P33609 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pola1P33609 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pola1P33609 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pola1P33609 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pola1P33609 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pola1P33609 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Pola1P33609 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pola1P33609 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pola1P33609 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pola1P33609 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pola1P33609 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pola1P33609 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pola1P33609 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pola1P33609 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pola1P33609 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pola1P33609 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pola1P33609 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Pola1P33609 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pola1P33609 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Pola1P33609 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pola1P33609 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pola1P33609 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pola1P33609 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Pola1P33609 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pola1P33609 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pola1P33609 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pola1P33609 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pola1P33609 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pola1P33609 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pola1P33609 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pola1P33609 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Pola1P33609 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pola1P33609 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pola1P33609 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Pola1P33609 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pola1P33609 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Pola1P33609 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Pola1P33609 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pola1P33609 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Pola1P33609 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Pola1P33609 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pola1P33609 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Pola1P33609 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pola1P33609 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pola1P33609 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pola1P33609 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pola1P33609 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pola1P33609 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Pola1P33609 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pola1P33609 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pola1P33609 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pola1P33609 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pola1P33609 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Pola1P33609 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Pola1P33609 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Pola1P33609 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Pola1P33609 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pola1P33609 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pola1P33609 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pola1P33609 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Pola1P33609 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pola1P33609 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pola1P33609 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Pola1P33609 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Pola1P33609 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Pola1P33609 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pola1P33609 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pola1P33609 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pola1P33609 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pola1P33609 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pola1P33609 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pola1P33609 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pola1P33609 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pola1P33609 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pola1P33609 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pola1P33609 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pola1P33609 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pola1P33609 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pola1P33609 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pola1P33609 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pola1P33609 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pola1P33609 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pola1P33609 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms