Protein–RNA interactions for Protein: P31257

Hoxc10, Homeobox protein Hox-C10, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc10P31257 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hoxc10P31257 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hoxc10P31257 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Hoxc10P31257 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hoxc10P31257 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hoxc10P31257 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Hoxc10P31257 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hoxc10P31257 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hoxc10P31257 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hoxc10P31257 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hoxc10P31257 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hoxc10P31257 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hoxc10P31257 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hoxc10P31257 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Hoxc10P31257 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Hoxc10P31257 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Hoxc10P31257 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hoxc10P31257 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hoxc10P31257 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hoxc10P31257 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hoxc10P31257 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Hoxc10P31257 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hoxc10P31257 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hoxc10P31257 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hoxc10P31257 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hoxc10P31257 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hoxc10P31257 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hoxc10P31257 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hoxc10P31257 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hoxc10P31257 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hoxc10P31257 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hoxc10P31257 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hoxc10P31257 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hoxc10P31257 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hoxc10P31257 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hoxc10P31257 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hoxc10P31257 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Hoxc10P31257 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Hoxc10P31257 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hoxc10P31257 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hoxc10P31257 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hoxc10P31257 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hoxc10P31257 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hoxc10P31257 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hoxc10P31257 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hoxc10P31257 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hoxc10P31257 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hoxc10P31257 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hoxc10P31257 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hoxc10P31257 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hoxc10P31257 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hoxc10P31257 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hoxc10P31257 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hoxc10P31257 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Hoxc10P31257 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hoxc10P31257 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Hoxc10P31257 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hoxc10P31257 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hoxc10P31257 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hoxc10P31257 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hoxc10P31257 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hoxc10P31257 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hoxc10P31257 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hoxc10P31257 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hoxc10P31257 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hoxc10P31257 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hoxc10P31257 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hoxc10P31257 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hoxc10P31257 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hoxc10P31257 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hoxc10P31257 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hoxc10P31257 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hoxc10P31257 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hoxc10P31257 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hoxc10P31257 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hoxc10P31257 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hoxc10P31257 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hoxc10P31257 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Hoxc10P31257 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Hoxc10P31257 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hoxc10P31257 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hoxc10P31257 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hoxc10P31257 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hoxc10P31257 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hoxc10P31257 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hoxc10P31257 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hoxc10P31257 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hoxc10P31257 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hoxc10P31257 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hoxc10P31257 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hoxc10P31257 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hoxc10P31257 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hoxc10P31257 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hoxc10P31257 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hoxc10P31257 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hoxc10P31257 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hoxc10P31257 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hoxc10P31257 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hoxc10P31257 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hoxc10P31257 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms