Protein–RNA interactions for Protein: P31245

Hoxa2, Homeobox protein Hox-A2, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa2P31245 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxa2P31245 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxa2P31245 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxa2P31245 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxa2P31245 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxa2P31245 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxa2P31245 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxa2P31245 Defb30-202ENSMUST00000111207 989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxa2P31245 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxa2P31245 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxa2P31245 Tbata-210ENSMUST00000151886 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxa2P31245 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxa2P31245 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxa2P31245 2900064F13Rik-201ENSMUST00000202166 1008 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxa2P31245 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxa2P31245 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxa2P31245 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxa2P31245 CT025642.1-201ENSMUST00000224734 1219 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxa2P31245 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxa2P31245 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxa2P31245 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxa2P31245 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxa2P31245 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxa2P31245 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxa2P31245 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxa2P31245 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxa2P31245 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxa2P31245 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxa2P31245 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxa2P31245 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxa2P31245 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxa2P31245 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxa2P31245 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxa2P31245 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxa2P31245 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxa2P31245 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxa2P31245 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxa2P31245 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxa2P31245 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxa2P31245 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxa2P31245 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxa2P31245 Gm14776-201ENSMUST00000121029 887 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxa2P31245 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxa2P31245 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxa2P31245 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxa2P31245 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxa2P31245 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxa2P31245 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxa2P31245 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxa2P31245 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxa2P31245 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxa2P31245 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxa2P31245 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxa2P31245 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxa2P31245 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxa2P31245 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxa2P31245 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxa2P31245 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxa2P31245 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxa2P31245 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxa2P31245 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxa2P31245 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxa2P31245 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxa2P31245 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxa2P31245 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxa2P31245 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxa2P31245 Atp6v1c2-207ENSMUST00000156727 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxa2P31245 Adam3-210ENSMUST00000171611 1202 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxa2P31245 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxa2P31245 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxa2P31245 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxa2P31245 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxa2P31245 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxa2P31245 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxa2P31245 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxa2P31245 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxa2P31245 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxa2P31245 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxa2P31245 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxa2P31245 Hormad1-201ENSMUST00000029754 1385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxa2P31245 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxa2P31245 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxa2P31245 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxa2P31245 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxa2P31245 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxa2P31245 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxa2P31245 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxa2P31245 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxa2P31245 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxa2P31245 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxa2P31245 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxa2P31245 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxa2P31245 Gm45574-201ENSMUST00000210921 331 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxa2P31245 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxa2P31245 AC079680.1-201ENSMUST00000218730 649 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxa2P31245 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxa2P31245 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxa2P31245 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxa2P31245 4933400A11Rik-201ENSMUST00000068874 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxa2P31245 4933400A11Rik-202ENSMUST00000068894 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms