Protein–RNA interactions for Protein: P31041

Cd28, T-cell-specific surface glycoprotein CD28, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd28P31041 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cd28P31041 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cd28P31041 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cd28P31041 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cd28P31041 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cd28P31041 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cd28P31041 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cd28P31041 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cd28P31041 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cd28P31041 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cd28P31041 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cd28P31041 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cd28P31041 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cd28P31041 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cd28P31041 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cd28P31041 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Cd28P31041 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Cd28P31041 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cd28P31041 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cd28P31041 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cd28P31041 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cd28P31041 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cd28P31041 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cd28P31041 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cd28P31041 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cd28P31041 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cd28P31041 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cd28P31041 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cd28P31041 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cd28P31041 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cd28P31041 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cd28P31041 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cd28P31041 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cd28P31041 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cd28P31041 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cd28P31041 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cd28P31041 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cd28P31041 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cd28P31041 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cd28P31041 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cd28P31041 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cd28P31041 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Cd28P31041 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cd28P31041 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cd28P31041 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cd28P31041 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cd28P31041 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cd28P31041 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cd28P31041 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cd28P31041 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Cd28P31041 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cd28P31041 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cd28P31041 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cd28P31041 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cd28P31041 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cd28P31041 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cd28P31041 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cd28P31041 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cd28P31041 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cd28P31041 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cd28P31041 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cd28P31041 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cd28P31041 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cd28P31041 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cd28P31041 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Cd28P31041 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cd28P31041 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cd28P31041 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cd28P31041 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cd28P31041 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cd28P31041 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cd28P31041 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cd28P31041 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cd28P31041 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cd28P31041 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cd28P31041 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Cd28P31041 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cd28P31041 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cd28P31041 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cd28P31041 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cd28P31041 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cd28P31041 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cd28P31041 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cd28P31041 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cd28P31041 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cd28P31041 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cd28P31041 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cd28P31041 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cd28P31041 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cd28P31041 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cd28P31041 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cd28P31041 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cd28P31041 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cd28P31041 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cd28P31041 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cd28P31041 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cd28P31041 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cd28P31041 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cd28P31041 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cd28P31041 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
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