Protein–RNA interactions for Protein: P29788

Vtn, Vitronectin, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VtnP29788 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
VtnP29788 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
VtnP29788 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC14.28□□□□□ -0.12
VtnP29788 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
VtnP29788 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
VtnP29788 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
VtnP29788 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
VtnP29788 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
VtnP29788 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
VtnP29788 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
VtnP29788 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
VtnP29788 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
VtnP29788 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
VtnP29788 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
VtnP29788 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
VtnP29788 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
VtnP29788 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
VtnP29788 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
VtnP29788 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
VtnP29788 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
VtnP29788 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
VtnP29788 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
VtnP29788 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
VtnP29788 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
VtnP29788 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.12
VtnP29788 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
VtnP29788 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
VtnP29788 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
VtnP29788 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
VtnP29788 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
VtnP29788 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
VtnP29788 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
VtnP29788 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
VtnP29788 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
VtnP29788 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
VtnP29788 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
VtnP29788 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
VtnP29788 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
VtnP29788 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
VtnP29788 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
VtnP29788 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
VtnP29788 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
VtnP29788 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
VtnP29788 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
VtnP29788 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
VtnP29788 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
VtnP29788 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
VtnP29788 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
VtnP29788 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
VtnP29788 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
VtnP29788 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
VtnP29788 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
VtnP29788 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
VtnP29788 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
VtnP29788 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
VtnP29788 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
VtnP29788 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
VtnP29788 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
VtnP29788 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
VtnP29788 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
VtnP29788 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
VtnP29788 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
VtnP29788 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
VtnP29788 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
VtnP29788 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
VtnP29788 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
VtnP29788 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
VtnP29788 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
VtnP29788 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
VtnP29788 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
VtnP29788 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
VtnP29788 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
VtnP29788 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
VtnP29788 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
VtnP29788 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
VtnP29788 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
VtnP29788 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
VtnP29788 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
VtnP29788 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
VtnP29788 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
VtnP29788 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
VtnP29788 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
VtnP29788 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
VtnP29788 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
VtnP29788 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
VtnP29788 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
VtnP29788 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
VtnP29788 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
VtnP29788 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
VtnP29788 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
VtnP29788 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
VtnP29788 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
VtnP29788 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
VtnP29788 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
VtnP29788 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
VtnP29788 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
VtnP29788 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
VtnP29788 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
VtnP29788 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
VtnP29788 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms