Protein–RNA interactions for Protein: P29341

Pabpc1, Polyadenylate-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc1P29341 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pabpc1P29341 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pabpc1P29341 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pabpc1P29341 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pabpc1P29341 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pabpc1P29341 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Pabpc1P29341 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pabpc1P29341 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pabpc1P29341 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pabpc1P29341 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pabpc1P29341 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pabpc1P29341 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pabpc1P29341 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pabpc1P29341 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pabpc1P29341 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pabpc1P29341 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pabpc1P29341 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pabpc1P29341 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pabpc1P29341 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Pabpc1P29341 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pabpc1P29341 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pabpc1P29341 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Pabpc1P29341 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pabpc1P29341 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Pabpc1P29341 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pabpc1P29341 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pabpc1P29341 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pabpc1P29341 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pabpc1P29341 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pabpc1P29341 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pabpc1P29341 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pabpc1P29341 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pabpc1P29341 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pabpc1P29341 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pabpc1P29341 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pabpc1P29341 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pabpc1P29341 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pabpc1P29341 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pabpc1P29341 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pabpc1P29341 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pabpc1P29341 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pabpc1P29341 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pabpc1P29341 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pabpc1P29341 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pabpc1P29341 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pabpc1P29341 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pabpc1P29341 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pabpc1P29341 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pabpc1P29341 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pabpc1P29341 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pabpc1P29341 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pabpc1P29341 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pabpc1P29341 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pabpc1P29341 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pabpc1P29341 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Pabpc1P29341 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pabpc1P29341 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pabpc1P29341 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Pabpc1P29341 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pabpc1P29341 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pabpc1P29341 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pabpc1P29341 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pabpc1P29341 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pabpc1P29341 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pabpc1P29341 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pabpc1P29341 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Pabpc1P29341 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pabpc1P29341 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pabpc1P29341 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pabpc1P29341 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pabpc1P29341 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pabpc1P29341 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pabpc1P29341 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pabpc1P29341 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pabpc1P29341 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pabpc1P29341 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pabpc1P29341 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pabpc1P29341 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Pabpc1P29341 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pabpc1P29341 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pabpc1P29341 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pabpc1P29341 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pabpc1P29341 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pabpc1P29341 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pabpc1P29341 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pabpc1P29341 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Pabpc1P29341 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pabpc1P29341 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pabpc1P29341 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pabpc1P29341 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pabpc1P29341 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pabpc1P29341 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pabpc1P29341 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pabpc1P29341 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pabpc1P29341 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pabpc1P29341 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pabpc1P29341 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pabpc1P29341 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pabpc1P29341 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pabpc1P29341 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms