Protein–RNA interactions for Protein: P28704

Rxrb, Retinoic acid receptor RXR-beta, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxrbP28704 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RxrbP28704 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RxrbP28704 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RxrbP28704 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RxrbP28704 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RxrbP28704 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RxrbP28704 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RxrbP28704 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RxrbP28704 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RxrbP28704 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RxrbP28704 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RxrbP28704 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RxrbP28704 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RxrbP28704 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RxrbP28704 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RxrbP28704 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RxrbP28704 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RxrbP28704 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RxrbP28704 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RxrbP28704 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RxrbP28704 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RxrbP28704 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RxrbP28704 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RxrbP28704 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RxrbP28704 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RxrbP28704 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RxrbP28704 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RxrbP28704 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RxrbP28704 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RxrbP28704 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RxrbP28704 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
RxrbP28704 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RxrbP28704 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RxrbP28704 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RxrbP28704 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RxrbP28704 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RxrbP28704 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RxrbP28704 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RxrbP28704 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RxrbP28704 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RxrbP28704 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RxrbP28704 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RxrbP28704 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RxrbP28704 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RxrbP28704 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RxrbP28704 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
RxrbP28704 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
RxrbP28704 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RxrbP28704 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RxrbP28704 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RxrbP28704 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RxrbP28704 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RxrbP28704 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RxrbP28704 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RxrbP28704 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RxrbP28704 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RxrbP28704 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RxrbP28704 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RxrbP28704 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RxrbP28704 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RxrbP28704 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RxrbP28704 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RxrbP28704 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RxrbP28704 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RxrbP28704 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RxrbP28704 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RxrbP28704 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RxrbP28704 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RxrbP28704 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RxrbP28704 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RxrbP28704 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RxrbP28704 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RxrbP28704 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RxrbP28704 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RxrbP28704 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RxrbP28704 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RxrbP28704 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RxrbP28704 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RxrbP28704 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RxrbP28704 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RxrbP28704 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
RxrbP28704 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RxrbP28704 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RxrbP28704 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RxrbP28704 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RxrbP28704 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RxrbP28704 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RxrbP28704 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RxrbP28704 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RxrbP28704 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RxrbP28704 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RxrbP28704 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
RxrbP28704 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RxrbP28704 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RxrbP28704 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
RxrbP28704 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RxrbP28704 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RxrbP28704 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RxrbP28704 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RxrbP28704 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
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