Protein–RNA interactions for Protein: P27870

Vav1, Proto-oncogene vav, mousemouse

Predictions only

Length 845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vav1P27870 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vav1P27870 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vav1P27870 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vav1P27870 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vav1P27870 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vav1P27870 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vav1P27870 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vav1P27870 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vav1P27870 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vav1P27870 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vav1P27870 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vav1P27870 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vav1P27870 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vav1P27870 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vav1P27870 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vav1P27870 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vav1P27870 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vav1P27870 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vav1P27870 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vav1P27870 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vav1P27870 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vav1P27870 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Vav1P27870 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vav1P27870 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vav1P27870 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vav1P27870 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vav1P27870 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vav1P27870 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vav1P27870 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vav1P27870 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vav1P27870 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vav1P27870 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vav1P27870 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vav1P27870 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Vav1P27870 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vav1P27870 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Vav1P27870 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vav1P27870 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vav1P27870 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Vav1P27870 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vav1P27870 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vav1P27870 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vav1P27870 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vav1P27870 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vav1P27870 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vav1P27870 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vav1P27870 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vav1P27870 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vav1P27870 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vav1P27870 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vav1P27870 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vav1P27870 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vav1P27870 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vav1P27870 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vav1P27870 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vav1P27870 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vav1P27870 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vav1P27870 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vav1P27870 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vav1P27870 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vav1P27870 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Vav1P27870 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vav1P27870 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vav1P27870 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vav1P27870 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vav1P27870 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vav1P27870 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vav1P27870 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vav1P27870 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vav1P27870 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vav1P27870 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vav1P27870 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vav1P27870 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vav1P27870 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vav1P27870 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vav1P27870 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vav1P27870 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vav1P27870 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Vav1P27870 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vav1P27870 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vav1P27870 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vav1P27870 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vav1P27870 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vav1P27870 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vav1P27870 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vav1P27870 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vav1P27870 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vav1P27870 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vav1P27870 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vav1P27870 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vav1P27870 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vav1P27870 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vav1P27870 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vav1P27870 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vav1P27870 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vav1P27870 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vav1P27870 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vav1P27870 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vav1P27870 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vav1P27870 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms