Protein–RNA interactions for Protein: P27664

Pde6a, Rod cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha, mousemouse

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Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6aP27664 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pde6aP27664 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pde6aP27664 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pde6aP27664 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pde6aP27664 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pde6aP27664 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pde6aP27664 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pde6aP27664 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pde6aP27664 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pde6aP27664 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pde6aP27664 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pde6aP27664 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pde6aP27664 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Pde6aP27664 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pde6aP27664 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pde6aP27664 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pde6aP27664 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Pde6aP27664 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pde6aP27664 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pde6aP27664 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pde6aP27664 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Pde6aP27664 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pde6aP27664 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pde6aP27664 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pde6aP27664 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pde6aP27664 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pde6aP27664 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pde6aP27664 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pde6aP27664 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pde6aP27664 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pde6aP27664 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pde6aP27664 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pde6aP27664 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pde6aP27664 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pde6aP27664 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pde6aP27664 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pde6aP27664 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pde6aP27664 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pde6aP27664 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pde6aP27664 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pde6aP27664 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pde6aP27664 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pde6aP27664 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pde6aP27664 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pde6aP27664 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Pde6aP27664 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pde6aP27664 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pde6aP27664 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Pde6aP27664 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Pde6aP27664 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Pde6aP27664 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Pde6aP27664 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Pde6aP27664 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Pde6aP27664 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Pde6aP27664 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Pde6aP27664 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pde6aP27664 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pde6aP27664 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pde6aP27664 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pde6aP27664 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pde6aP27664 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Pde6aP27664 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pde6aP27664 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pde6aP27664 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
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Pde6aP27664 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pde6aP27664 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pde6aP27664 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Pde6aP27664 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pde6aP27664 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pde6aP27664 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pde6aP27664 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pde6aP27664 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pde6aP27664 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pde6aP27664 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pde6aP27664 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pde6aP27664 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pde6aP27664 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pde6aP27664 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pde6aP27664 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pde6aP27664 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pde6aP27664 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pde6aP27664 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pde6aP27664 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pde6aP27664 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pde6aP27664 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Pde6aP27664 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Pde6aP27664 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pde6aP27664 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pde6aP27664 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pde6aP27664 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pde6aP27664 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pde6aP27664 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pde6aP27664 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pde6aP27664 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pde6aP27664 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pde6aP27664 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pde6aP27664 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pde6aP27664 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
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