Protein–RNA interactions for Protein: P26369

U2af2, Splicing factor U2AF 65 kDa subunit, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2af2P26369 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
U2af2P26369 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
U2af2P26369 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
U2af2P26369 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
U2af2P26369 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
U2af2P26369 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
U2af2P26369 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
U2af2P26369 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
U2af2P26369 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
U2af2P26369 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
U2af2P26369 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
U2af2P26369 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
U2af2P26369 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
U2af2P26369 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
U2af2P26369 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
U2af2P26369 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
U2af2P26369 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
U2af2P26369 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
U2af2P26369 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
U2af2P26369 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
U2af2P26369 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
U2af2P26369 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
U2af2P26369 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
U2af2P26369 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
U2af2P26369 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
U2af2P26369 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
U2af2P26369 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
U2af2P26369 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
U2af2P26369 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
U2af2P26369 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
U2af2P26369 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
U2af2P26369 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
U2af2P26369 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
U2af2P26369 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
U2af2P26369 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
U2af2P26369 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
U2af2P26369 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
U2af2P26369 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
U2af2P26369 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
U2af2P26369 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
U2af2P26369 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
U2af2P26369 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
U2af2P26369 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
U2af2P26369 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
U2af2P26369 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
U2af2P26369 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
U2af2P26369 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
U2af2P26369 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
U2af2P26369 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
U2af2P26369 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
U2af2P26369 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
U2af2P26369 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
U2af2P26369 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
U2af2P26369 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
U2af2P26369 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
U2af2P26369 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
U2af2P26369 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
U2af2P26369 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
U2af2P26369 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
U2af2P26369 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
U2af2P26369 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
U2af2P26369 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
U2af2P26369 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
U2af2P26369 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
U2af2P26369 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
U2af2P26369 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
U2af2P26369 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
U2af2P26369 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
U2af2P26369 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
U2af2P26369 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
U2af2P26369 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
U2af2P26369 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
U2af2P26369 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
U2af2P26369 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
U2af2P26369 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
U2af2P26369 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
U2af2P26369 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
U2af2P26369 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
U2af2P26369 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
U2af2P26369 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
U2af2P26369 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
U2af2P26369 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
U2af2P26369 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
U2af2P26369 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
U2af2P26369 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
U2af2P26369 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
U2af2P26369 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
U2af2P26369 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
U2af2P26369 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
U2af2P26369 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
U2af2P26369 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
U2af2P26369 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
U2af2P26369 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
U2af2P26369 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
U2af2P26369 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
U2af2P26369 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
U2af2P26369 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
U2af2P26369 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
U2af2P26369 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
U2af2P26369 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms