Protein–RNA interactions for Protein: P25801

Lmo2, Rhombotin-2, mousemouse

Predictions only

Length 158 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo2P25801 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lmo2P25801 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lmo2P25801 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lmo2P25801 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lmo2P25801 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Lmo2P25801 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lmo2P25801 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lmo2P25801 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lmo2P25801 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Lmo2P25801 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lmo2P25801 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lmo2P25801 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lmo2P25801 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Lmo2P25801 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lmo2P25801 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lmo2P25801 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lmo2P25801 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lmo2P25801 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lmo2P25801 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lmo2P25801 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lmo2P25801 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lmo2P25801 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lmo2P25801 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Lmo2P25801 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lmo2P25801 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lmo2P25801 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Lmo2P25801 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lmo2P25801 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lmo2P25801 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lmo2P25801 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lmo2P25801 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lmo2P25801 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lmo2P25801 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lmo2P25801 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lmo2P25801 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lmo2P25801 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lmo2P25801 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lmo2P25801 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Lmo2P25801 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lmo2P25801 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lmo2P25801 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lmo2P25801 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lmo2P25801 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lmo2P25801 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lmo2P25801 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lmo2P25801 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lmo2P25801 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lmo2P25801 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lmo2P25801 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lmo2P25801 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lmo2P25801 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lmo2P25801 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lmo2P25801 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Lmo2P25801 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Lmo2P25801 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lmo2P25801 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Lmo2P25801 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lmo2P25801 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lmo2P25801 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lmo2P25801 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lmo2P25801 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Lmo2P25801 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lmo2P25801 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lmo2P25801 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lmo2P25801 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lmo2P25801 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lmo2P25801 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lmo2P25801 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lmo2P25801 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lmo2P25801 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lmo2P25801 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lmo2P25801 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lmo2P25801 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lmo2P25801 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lmo2P25801 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lmo2P25801 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lmo2P25801 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lmo2P25801 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lmo2P25801 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lmo2P25801 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lmo2P25801 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lmo2P25801 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lmo2P25801 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lmo2P25801 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lmo2P25801 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lmo2P25801 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lmo2P25801 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lmo2P25801 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lmo2P25801 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Lmo2P25801 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Lmo2P25801 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lmo2P25801 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lmo2P25801 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lmo2P25801 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lmo2P25801 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lmo2P25801 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lmo2P25801 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lmo2P25801 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Lmo2P25801 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lmo2P25801 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms