Protein–RNA interactions for Protein: P22518

Clk1, Dual specificity protein kinase CLK1, mousemouse

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clk1P22518 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Clk1P22518 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Clk1P22518 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Clk1P22518 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Clk1P22518 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Clk1P22518 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Clk1P22518 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Clk1P22518 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Clk1P22518 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Clk1P22518 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Clk1P22518 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Clk1P22518 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Clk1P22518 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
Clk1P22518 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Clk1P22518 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clk1P22518 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clk1P22518 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clk1P22518 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clk1P22518 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clk1P22518 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clk1P22518 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clk1P22518 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clk1P22518 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clk1P22518 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clk1P22518 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Clk1P22518 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clk1P22518 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clk1P22518 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Clk1P22518 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clk1P22518 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clk1P22518 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clk1P22518 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clk1P22518 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clk1P22518 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clk1P22518 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clk1P22518 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clk1P22518 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clk1P22518 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clk1P22518 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clk1P22518 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clk1P22518 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clk1P22518 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clk1P22518 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clk1P22518 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clk1P22518 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clk1P22518 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clk1P22518 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clk1P22518 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clk1P22518 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clk1P22518 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clk1P22518 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clk1P22518 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clk1P22518 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clk1P22518 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clk1P22518 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clk1P22518 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clk1P22518 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clk1P22518 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clk1P22518 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clk1P22518 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clk1P22518 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clk1P22518 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clk1P22518 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clk1P22518 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clk1P22518 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Clk1P22518 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clk1P22518 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clk1P22518 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clk1P22518 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clk1P22518 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clk1P22518 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clk1P22518 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clk1P22518 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clk1P22518 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clk1P22518 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clk1P22518 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clk1P22518 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clk1P22518 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clk1P22518 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Clk1P22518 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Clk1P22518 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Clk1P22518 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Clk1P22518 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Clk1P22518 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Clk1P22518 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Clk1P22518 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Clk1P22518 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Clk1P22518 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Clk1P22518 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Clk1P22518 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Clk1P22518 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Clk1P22518 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Clk1P22518 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Clk1P22518 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Clk1P22518 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Clk1P22518 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Clk1P22518 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Clk1P22518 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Clk1P22518 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Clk1P22518 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms