Protein–RNA interactions for Protein: P20489

Fcer1a, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcer1aP20489 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Fcer1aP20489 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Fcer1aP20489 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Fcer1aP20489 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Fcer1aP20489 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Fcer1aP20489 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Fcer1aP20489 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Fcer1aP20489 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Fcer1aP20489 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Fcer1aP20489 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Fcer1aP20489 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Fcer1aP20489 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Fcer1aP20489 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Fcer1aP20489 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Fcer1aP20489 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Fcer1aP20489 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Fcer1aP20489 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Fcer1aP20489 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Fcer1aP20489 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Fcer1aP20489 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Fcer1aP20489 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Fcer1aP20489 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Fcer1aP20489 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Fcer1aP20489 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Fcer1aP20489 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Fcer1aP20489 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Fcer1aP20489 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Fcer1aP20489 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Fcer1aP20489 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Fcer1aP20489 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Fcer1aP20489 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Fcer1aP20489 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Fcer1aP20489 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Fcer1aP20489 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Fcer1aP20489 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Fcer1aP20489 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Fcer1aP20489 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Fcer1aP20489 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Fcer1aP20489 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Fcer1aP20489 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Fcer1aP20489 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Fcer1aP20489 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Fcer1aP20489 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Fcer1aP20489 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Fcer1aP20489 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Fcer1aP20489 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Fcer1aP20489 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Fcer1aP20489 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Fcer1aP20489 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Fcer1aP20489 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Fcer1aP20489 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Fcer1aP20489 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Fcer1aP20489 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Fcer1aP20489 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Fcer1aP20489 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Fcer1aP20489 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Fcer1aP20489 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Fcer1aP20489 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Fcer1aP20489 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Fcer1aP20489 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Fcer1aP20489 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Fcer1aP20489 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Fcer1aP20489 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Fcer1aP20489 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Fcer1aP20489 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Fcer1aP20489 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Fcer1aP20489 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Fcer1aP20489 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Fcer1aP20489 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Fcer1aP20489 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Fcer1aP20489 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Fcer1aP20489 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Fcer1aP20489 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Fcer1aP20489 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Fcer1aP20489 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Fcer1aP20489 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Fcer1aP20489 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Fcer1aP20489 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Fcer1aP20489 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Fcer1aP20489 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Fcer1aP20489 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Fcer1aP20489 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Fcer1aP20489 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Fcer1aP20489 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Fcer1aP20489 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Fcer1aP20489 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Fcer1aP20489 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Fcer1aP20489 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Fcer1aP20489 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Fcer1aP20489 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Fcer1aP20489 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Fcer1aP20489 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Fcer1aP20489 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Fcer1aP20489 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Fcer1aP20489 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Fcer1aP20489 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Fcer1aP20489 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Fcer1aP20489 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Fcer1aP20489 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Fcer1aP20489 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms