Protein–RNA interactions for Protein: P20293

T, Brachyury protein, mousemouse

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Length 436 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TP20293 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TP20293 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TP20293 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TP20293 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TP20293 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
TP20293 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TP20293 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TP20293 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TP20293 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TP20293 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TP20293 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TP20293 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TP20293 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TP20293 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TP20293 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TP20293 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TP20293 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TP20293 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
TP20293 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TP20293 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
TP20293 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TP20293 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TP20293 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TP20293 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
TP20293 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TP20293 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TP20293 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TP20293 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TP20293 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TP20293 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TP20293 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TP20293 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TP20293 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TP20293 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TP20293 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TP20293 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TP20293 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TP20293 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TP20293 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TP20293 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TP20293 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TP20293 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TP20293 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
TP20293 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TP20293 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TP20293 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TP20293 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TP20293 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TP20293 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TP20293 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TP20293 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TP20293 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TP20293 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TP20293 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TP20293 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TP20293 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TP20293 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TP20293 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TP20293 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TP20293 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TP20293 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TP20293 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TP20293 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TP20293 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
TP20293 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TP20293 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TP20293 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TP20293 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
TP20293 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TP20293 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TP20293 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TP20293 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TP20293 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TP20293 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TP20293 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TP20293 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TP20293 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TP20293 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TP20293 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TP20293 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TP20293 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TP20293 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TP20293 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TP20293 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TP20293 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TP20293 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TP20293 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TP20293 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TP20293 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TP20293 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TP20293 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TP20293 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TP20293 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TP20293 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TP20293 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TP20293 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TP20293 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
TP20293 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TP20293 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TP20293 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.5 ms