Protein–RNA interactions for Protein: P19426

Nelfe, Negative elongation factor E, mousemouse

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Length 375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NelfeP19426 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NelfeP19426 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NelfeP19426 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NelfeP19426 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NelfeP19426 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NelfeP19426 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NelfeP19426 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NelfeP19426 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NelfeP19426 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NelfeP19426 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NelfeP19426 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NelfeP19426 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
NelfeP19426 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NelfeP19426 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NelfeP19426 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NelfeP19426 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NelfeP19426 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NelfeP19426 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NelfeP19426 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NelfeP19426 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NelfeP19426 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NelfeP19426 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NelfeP19426 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NelfeP19426 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NelfeP19426 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NelfeP19426 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NelfeP19426 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NelfeP19426 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NelfeP19426 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NelfeP19426 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NelfeP19426 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
NelfeP19426 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NelfeP19426 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NelfeP19426 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NelfeP19426 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NelfeP19426 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
NelfeP19426 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NelfeP19426 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NelfeP19426 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NelfeP19426 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
NelfeP19426 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NelfeP19426 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NelfeP19426 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NelfeP19426 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NelfeP19426 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NelfeP19426 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NelfeP19426 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NelfeP19426 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NelfeP19426 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NelfeP19426 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NelfeP19426 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NelfeP19426 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NelfeP19426 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NelfeP19426 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NelfeP19426 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NelfeP19426 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NelfeP19426 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NelfeP19426 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NelfeP19426 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NelfeP19426 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NelfeP19426 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NelfeP19426 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NelfeP19426 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NelfeP19426 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NelfeP19426 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NelfeP19426 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NelfeP19426 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NelfeP19426 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NelfeP19426 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NelfeP19426 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NelfeP19426 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NelfeP19426 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NelfeP19426 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NelfeP19426 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NelfeP19426 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NelfeP19426 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NelfeP19426 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NelfeP19426 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NelfeP19426 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NelfeP19426 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NelfeP19426 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NelfeP19426 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NelfeP19426 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NelfeP19426 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NelfeP19426 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NelfeP19426 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NelfeP19426 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NelfeP19426 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NelfeP19426 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NelfeP19426 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NelfeP19426 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NelfeP19426 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NelfeP19426 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NelfeP19426 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NelfeP19426 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NelfeP19426 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NelfeP19426 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NelfeP19426 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NelfeP19426 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NelfeP19426 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms