Protein–RNA interactions for Protein: P19246

Nefh, Neurofilament heavy polypeptide, mousemouse

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Length 1,090 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NefhP19246 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NefhP19246 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NefhP19246 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NefhP19246 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NefhP19246 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NefhP19246 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NefhP19246 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NefhP19246 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NefhP19246 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NefhP19246 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
NefhP19246 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NefhP19246 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NefhP19246 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NefhP19246 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
NefhP19246 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NefhP19246 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NefhP19246 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
NefhP19246 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NefhP19246 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NefhP19246 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NefhP19246 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NefhP19246 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NefhP19246 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NefhP19246 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NefhP19246 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NefhP19246 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NefhP19246 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NefhP19246 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NefhP19246 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NefhP19246 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NefhP19246 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NefhP19246 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NefhP19246 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NefhP19246 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NefhP19246 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NefhP19246 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NefhP19246 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NefhP19246 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NefhP19246 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NefhP19246 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NefhP19246 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NefhP19246 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NefhP19246 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NefhP19246 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NefhP19246 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NefhP19246 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NefhP19246 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
NefhP19246 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NefhP19246 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
NefhP19246 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
NefhP19246 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NefhP19246 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
NefhP19246 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NefhP19246 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NefhP19246 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NefhP19246 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NefhP19246 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NefhP19246 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NefhP19246 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NefhP19246 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
NefhP19246 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
NefhP19246 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NefhP19246 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NefhP19246 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NefhP19246 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NefhP19246 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NefhP19246 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NefhP19246 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NefhP19246 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NefhP19246 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
NefhP19246 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NefhP19246 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NefhP19246 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NefhP19246 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NefhP19246 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NefhP19246 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NefhP19246 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NefhP19246 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NefhP19246 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NefhP19246 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
NefhP19246 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NefhP19246 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
NefhP19246 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NefhP19246 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
NefhP19246 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NefhP19246 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NefhP19246 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NefhP19246 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NefhP19246 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NefhP19246 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NefhP19246 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NefhP19246 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NefhP19246 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NefhP19246 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NefhP19246 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NefhP19246 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NefhP19246 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
NefhP19246 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
NefhP19246 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NefhP19246 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms