Protein–RNA interactions for Protein: P19228

Csn1s1, Alpha-S1-casein, mousemouse

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Length 313 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csn1s1P19228 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Csn1s1P19228 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Csn1s1P19228 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Csn1s1P19228 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Csn1s1P19228 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Csn1s1P19228 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Csn1s1P19228 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Csn1s1P19228 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Csn1s1P19228 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Csn1s1P19228 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Csn1s1P19228 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Csn1s1P19228 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Csn1s1P19228 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Csn1s1P19228 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Csn1s1P19228 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Csn1s1P19228 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Csn1s1P19228 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Csn1s1P19228 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Csn1s1P19228 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Csn1s1P19228 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Csn1s1P19228 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Csn1s1P19228 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Csn1s1P19228 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Csn1s1P19228 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Csn1s1P19228 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Csn1s1P19228 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Csn1s1P19228 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Csn1s1P19228 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Csn1s1P19228 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Csn1s1P19228 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Csn1s1P19228 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Csn1s1P19228 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Csn1s1P19228 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Csn1s1P19228 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Csn1s1P19228 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Csn1s1P19228 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Csn1s1P19228 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Csn1s1P19228 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Csn1s1P19228 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Csn1s1P19228 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Csn1s1P19228 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Csn1s1P19228 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Csn1s1P19228 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Csn1s1P19228 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Csn1s1P19228 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Csn1s1P19228 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Csn1s1P19228 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Csn1s1P19228 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Csn1s1P19228 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Csn1s1P19228 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Csn1s1P19228 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Csn1s1P19228 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Csn1s1P19228 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Csn1s1P19228 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Csn1s1P19228 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Csn1s1P19228 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Csn1s1P19228 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Csn1s1P19228 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Csn1s1P19228 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Csn1s1P19228 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Csn1s1P19228 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Csn1s1P19228 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Csn1s1P19228 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Csn1s1P19228 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Csn1s1P19228 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Csn1s1P19228 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Csn1s1P19228 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Csn1s1P19228 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Csn1s1P19228 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Csn1s1P19228 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Csn1s1P19228 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Csn1s1P19228 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Csn1s1P19228 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Csn1s1P19228 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Csn1s1P19228 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Csn1s1P19228 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Csn1s1P19228 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Csn1s1P19228 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Csn1s1P19228 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Csn1s1P19228 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Csn1s1P19228 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Csn1s1P19228 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Csn1s1P19228 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Csn1s1P19228 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Csn1s1P19228 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Csn1s1P19228 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Csn1s1P19228 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Csn1s1P19228 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Csn1s1P19228 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Csn1s1P19228 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Csn1s1P19228 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Csn1s1P19228 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Csn1s1P19228 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Csn1s1P19228 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Csn1s1P19228 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Csn1s1P19228 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Csn1s1P19228 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Csn1s1P19228 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Csn1s1P19228 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Csn1s1P19228 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms