Protein–RNA interactions for Protein: P18653

Rps6ka1, Ribosomal protein S6 kinase alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka1P18653 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rps6ka1P18653 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rps6ka1P18653 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rps6ka1P18653 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rps6ka1P18653 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rps6ka1P18653 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rps6ka1P18653 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rps6ka1P18653 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rps6ka1P18653 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rps6ka1P18653 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rps6ka1P18653 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rps6ka1P18653 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rps6ka1P18653 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rps6ka1P18653 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rps6ka1P18653 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rps6ka1P18653 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rps6ka1P18653 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rps6ka1P18653 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rps6ka1P18653 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rps6ka1P18653 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rps6ka1P18653 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rps6ka1P18653 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rps6ka1P18653 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rps6ka1P18653 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rps6ka1P18653 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rps6ka1P18653 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rps6ka1P18653 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rps6ka1P18653 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rps6ka1P18653 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Rps6ka1P18653 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rps6ka1P18653 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rps6ka1P18653 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rps6ka1P18653 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rps6ka1P18653 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rps6ka1P18653 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rps6ka1P18653 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rps6ka1P18653 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rps6ka1P18653 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rps6ka1P18653 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rps6ka1P18653 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rps6ka1P18653 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rps6ka1P18653 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rps6ka1P18653 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rps6ka1P18653 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rps6ka1P18653 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rps6ka1P18653 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rps6ka1P18653 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Rps6ka1P18653 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rps6ka1P18653 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rps6ka1P18653 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rps6ka1P18653 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rps6ka1P18653 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rps6ka1P18653 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rps6ka1P18653 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Rps6ka1P18653 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rps6ka1P18653 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rps6ka1P18653 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rps6ka1P18653 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rps6ka1P18653 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rps6ka1P18653 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rps6ka1P18653 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rps6ka1P18653 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rps6ka1P18653 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rps6ka1P18653 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rps6ka1P18653 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rps6ka1P18653 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rps6ka1P18653 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Rps6ka1P18653 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rps6ka1P18653 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rps6ka1P18653 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rps6ka1P18653 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rps6ka1P18653 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rps6ka1P18653 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rps6ka1P18653 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rps6ka1P18653 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rps6ka1P18653 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rps6ka1P18653 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Rps6ka1P18653 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rps6ka1P18653 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Rps6ka1P18653 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rps6ka1P18653 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rps6ka1P18653 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rps6ka1P18653 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rps6ka1P18653 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rps6ka1P18653 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Rps6ka1P18653 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rps6ka1P18653 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rps6ka1P18653 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rps6ka1P18653 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rps6ka1P18653 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rps6ka1P18653 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rps6ka1P18653 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rps6ka1P18653 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rps6ka1P18653 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Rps6ka1P18653 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rps6ka1P18653 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rps6ka1P18653 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rps6ka1P18653 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rps6ka1P18653 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rps6ka1P18653 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms