Protein–RNA interactions for Protein: P18533

Ig heavy chain V region 733, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18533 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
P18533 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
P18533 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
P18533 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
P18533 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
P18533 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
P18533 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
P18533 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
P18533 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
P18533 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
P18533 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
P18533 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
P18533 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
P18533 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
P18533 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
P18533 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
P18533 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
P18533 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
P18533 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
P18533 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
P18533 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
P18533 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
P18533 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
P18533 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
P18533 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
P18533 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
P18533 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
P18533 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
P18533 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
P18533 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
P18533 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
P18533 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
P18533 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
P18533 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
P18533 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
P18533 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
P18533 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
P18533 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
P18533 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
P18533 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
P18533 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
P18533 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
P18533 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
P18533 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
P18533 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
P18533 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
P18533 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
P18533 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
P18533 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
P18533 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
P18533 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
P18533 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
P18533 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
P18533 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
P18533 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
P18533 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
P18533 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
P18533 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
P18533 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
P18533 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
P18533 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
P18533 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
P18533 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
P18533 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
P18533 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
P18533 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
P18533 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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P18533 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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P18533 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
P18533 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
P18533 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
P18533 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
P18533 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
P18533 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
P18533 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
P18533 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
P18533 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
P18533 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
P18533 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
P18533 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
P18533 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
P18533 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
P18533 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
P18533 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
P18533 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
P18533 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
P18533 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
P18533 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
P18533 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
P18533 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
P18533 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
P18533 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
P18533 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
P18533 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
P18533 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
P18533 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
P18533 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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