Protein–RNA interactions for Protein: P18052

Ptpra, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, mousemouse

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Length 829 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpraP18052 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PtpraP18052 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PtpraP18052 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PtpraP18052 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PtpraP18052 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PtpraP18052 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PtpraP18052 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PtpraP18052 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PtpraP18052 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PtpraP18052 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PtpraP18052 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PtpraP18052 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PtpraP18052 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PtpraP18052 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PtpraP18052 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PtpraP18052 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PtpraP18052 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PtpraP18052 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PtpraP18052 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PtpraP18052 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PtpraP18052 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PtpraP18052 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PtpraP18052 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PtpraP18052 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PtpraP18052 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PtpraP18052 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PtpraP18052 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PtpraP18052 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PtpraP18052 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PtpraP18052 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PtpraP18052 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PtpraP18052 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PtpraP18052 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PtpraP18052 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PtpraP18052 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PtpraP18052 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PtpraP18052 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PtpraP18052 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PtpraP18052 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PtpraP18052 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PtpraP18052 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PtpraP18052 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PtpraP18052 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PtpraP18052 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PtpraP18052 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PtpraP18052 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PtpraP18052 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PtpraP18052 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PtpraP18052 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PtpraP18052 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PtpraP18052 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PtpraP18052 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PtpraP18052 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PtpraP18052 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PtpraP18052 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PtpraP18052 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PtpraP18052 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PtpraP18052 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PtpraP18052 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PtpraP18052 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PtpraP18052 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PtpraP18052 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PtpraP18052 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PtpraP18052 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PtpraP18052 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PtpraP18052 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PtpraP18052 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PtpraP18052 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PtpraP18052 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PtpraP18052 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PtpraP18052 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PtpraP18052 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
PtpraP18052 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PtpraP18052 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PtpraP18052 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PtpraP18052 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
PtpraP18052 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PtpraP18052 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PtpraP18052 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PtpraP18052 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PtpraP18052 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
PtpraP18052 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PtpraP18052 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PtpraP18052 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PtpraP18052 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PtpraP18052 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PtpraP18052 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PtpraP18052 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PtpraP18052 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PtpraP18052 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PtpraP18052 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PtpraP18052 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PtpraP18052 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PtpraP18052 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PtpraP18052 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PtpraP18052 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PtpraP18052 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PtpraP18052 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PtpraP18052 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PtpraP18052 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms