Protein–RNA interactions for Protein: P17095

Hmga1, High mobility group protein HMG-I/HMG-Y, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmga1P17095 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hmga1P17095 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hmga1P17095 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hmga1P17095 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Hmga1P17095 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hmga1P17095 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hmga1P17095 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hmga1P17095 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hmga1P17095 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hmga1P17095 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hmga1P17095 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hmga1P17095 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Hmga1P17095 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hmga1P17095 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Hmga1P17095 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hmga1P17095 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hmga1P17095 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Hmga1P17095 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hmga1P17095 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hmga1P17095 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hmga1P17095 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hmga1P17095 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hmga1P17095 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hmga1P17095 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hmga1P17095 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hmga1P17095 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hmga1P17095 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hmga1P17095 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hmga1P17095 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hmga1P17095 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hmga1P17095 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hmga1P17095 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Hmga1P17095 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hmga1P17095 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hmga1P17095 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hmga1P17095 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hmga1P17095 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hmga1P17095 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hmga1P17095 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Hmga1P17095 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hmga1P17095 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hmga1P17095 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hmga1P17095 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hmga1P17095 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hmga1P17095 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hmga1P17095 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hmga1P17095 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hmga1P17095 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hmga1P17095 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hmga1P17095 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Hmga1P17095 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hmga1P17095 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hmga1P17095 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hmga1P17095 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hmga1P17095 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hmga1P17095 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hmga1P17095 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hmga1P17095 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hmga1P17095 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hmga1P17095 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hmga1P17095 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hmga1P17095 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hmga1P17095 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hmga1P17095 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hmga1P17095 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hmga1P17095 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hmga1P17095 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hmga1P17095 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hmga1P17095 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hmga1P17095 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hmga1P17095 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hmga1P17095 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hmga1P17095 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hmga1P17095 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Hmga1P17095 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Hmga1P17095 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hmga1P17095 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hmga1P17095 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hmga1P17095 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hmga1P17095 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hmga1P17095 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hmga1P17095 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hmga1P17095 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hmga1P17095 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hmga1P17095 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hmga1P17095 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hmga1P17095 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hmga1P17095 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hmga1P17095 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hmga1P17095 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hmga1P17095 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hmga1P17095 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hmga1P17095 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hmga1P17095 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hmga1P17095 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hmga1P17095 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hmga1P17095 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hmga1P17095 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hmga1P17095 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hmga1P17095 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms