Protein–RNA interactions for Protein: P16546

Sptan1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptan1P16546 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sptan1P16546 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sptan1P16546 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sptan1P16546 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sptan1P16546 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sptan1P16546 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sptan1P16546 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sptan1P16546 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Sptan1P16546 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sptan1P16546 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sptan1P16546 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Sptan1P16546 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sptan1P16546 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sptan1P16546 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sptan1P16546 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sptan1P16546 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sptan1P16546 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sptan1P16546 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sptan1P16546 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sptan1P16546 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sptan1P16546 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sptan1P16546 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sptan1P16546 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sptan1P16546 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sptan1P16546 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sptan1P16546 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sptan1P16546 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sptan1P16546 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sptan1P16546 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sptan1P16546 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sptan1P16546 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sptan1P16546 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sptan1P16546 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Sptan1P16546 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sptan1P16546 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Sptan1P16546 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sptan1P16546 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sptan1P16546 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sptan1P16546 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sptan1P16546 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sptan1P16546 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sptan1P16546 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sptan1P16546 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sptan1P16546 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sptan1P16546 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sptan1P16546 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Sptan1P16546 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Sptan1P16546 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Sptan1P16546 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sptan1P16546 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sptan1P16546 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sptan1P16546 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sptan1P16546 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sptan1P16546 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sptan1P16546 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sptan1P16546 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sptan1P16546 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sptan1P16546 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sptan1P16546 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sptan1P16546 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sptan1P16546 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sptan1P16546 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sptan1P16546 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sptan1P16546 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sptan1P16546 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sptan1P16546 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sptan1P16546 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sptan1P16546 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sptan1P16546 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sptan1P16546 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sptan1P16546 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Sptan1P16546 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Sptan1P16546 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Sptan1P16546 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sptan1P16546 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sptan1P16546 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sptan1P16546 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sptan1P16546 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sptan1P16546 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sptan1P16546 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sptan1P16546 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sptan1P16546 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sptan1P16546 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sptan1P16546 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Sptan1P16546 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sptan1P16546 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sptan1P16546 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sptan1P16546 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sptan1P16546 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sptan1P16546 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sptan1P16546 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sptan1P16546 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sptan1P16546 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sptan1P16546 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sptan1P16546 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sptan1P16546 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sptan1P16546 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sptan1P16546 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sptan1P16546 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sptan1P16546 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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