Protein–RNA interactions for Protein: P14869

Rplp0, 60S acidic ribosomal protein P0, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rplp0P14869 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rplp0P14869 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Rplp0P14869 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Rplp0P14869 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rplp0P14869 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Rplp0P14869 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Rplp0P14869 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rplp0P14869 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rplp0P14869 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rplp0P14869 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rplp0P14869 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rplp0P14869 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rplp0P14869 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rplp0P14869 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rplp0P14869 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rplp0P14869 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rplp0P14869 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rplp0P14869 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rplp0P14869 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rplp0P14869 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rplp0P14869 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rplp0P14869 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rplp0P14869 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rplp0P14869 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rplp0P14869 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rplp0P14869 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rplp0P14869 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rplp0P14869 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rplp0P14869 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rplp0P14869 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rplp0P14869 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rplp0P14869 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rplp0P14869 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rplp0P14869 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rplp0P14869 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rplp0P14869 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rplp0P14869 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rplp0P14869 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rplp0P14869 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rplp0P14869 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rplp0P14869 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rplp0P14869 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rplp0P14869 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rplp0P14869 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rplp0P14869 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rplp0P14869 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rplp0P14869 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rplp0P14869 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rplp0P14869 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rplp0P14869 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rplp0P14869 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rplp0P14869 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rplp0P14869 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rplp0P14869 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rplp0P14869 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rplp0P14869 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rplp0P14869 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Rplp0P14869 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Rplp0P14869 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rplp0P14869 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rplp0P14869 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rplp0P14869 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Rplp0P14869 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rplp0P14869 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rplp0P14869 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rplp0P14869 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rplp0P14869 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rplp0P14869 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rplp0P14869 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rplp0P14869 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rplp0P14869 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rplp0P14869 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rplp0P14869 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rplp0P14869 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rplp0P14869 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rplp0P14869 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rplp0P14869 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rplp0P14869 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Rplp0P14869 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rplp0P14869 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rplp0P14869 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Rplp0P14869 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rplp0P14869 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Rplp0P14869 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rplp0P14869 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rplp0P14869 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rplp0P14869 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rplp0P14869 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rplp0P14869 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rplp0P14869 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rplp0P14869 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rplp0P14869 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rplp0P14869 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rplp0P14869 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rplp0P14869 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rplp0P14869 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rplp0P14869 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rplp0P14869 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rplp0P14869 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Rplp0P14869 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms