Protein–RNA interactions for Protein: P14576

Srp54, Signal recognition particle 54 kDa protein, mousemouse

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Length 504 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp54P14576 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Srp54P14576 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Srp54P14576 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Srp54P14576 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Srp54P14576 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Srp54P14576 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Srp54P14576 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Srp54P14576 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Srp54P14576 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Srp54P14576 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Srp54P14576 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Srp54P14576 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Srp54P14576 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Srp54P14576 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Srp54P14576 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Srp54P14576 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Srp54P14576 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Srp54P14576 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Srp54P14576 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Srp54P14576 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Srp54P14576 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Srp54P14576 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Srp54P14576 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Srp54P14576 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Srp54P14576 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Srp54P14576 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Srp54P14576 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Srp54P14576 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Srp54P14576 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Srp54P14576 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Srp54P14576 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Srp54P14576 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Srp54P14576 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Srp54P14576 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Srp54P14576 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Srp54P14576 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Srp54P14576 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Srp54P14576 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Srp54P14576 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Srp54P14576 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Srp54P14576 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Srp54P14576 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Srp54P14576 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Srp54P14576 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Srp54P14576 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Srp54P14576 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Srp54P14576 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Srp54P14576 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Srp54P14576 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Srp54P14576 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Srp54P14576 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Srp54P14576 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Srp54P14576 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Srp54P14576 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Srp54P14576 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Srp54P14576 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Srp54P14576 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Srp54P14576 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Srp54P14576 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Srp54P14576 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Srp54P14576 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Srp54P14576 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Srp54P14576 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Srp54P14576 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Srp54P14576 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Srp54P14576 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Srp54P14576 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Srp54P14576 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Srp54P14576 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Srp54P14576 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Srp54P14576 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Srp54P14576 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Srp54P14576 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Srp54P14576 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Srp54P14576 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Srp54P14576 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Srp54P14576 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Srp54P14576 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Srp54P14576 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Srp54P14576 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Srp54P14576 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Srp54P14576 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Srp54P14576 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Srp54P14576 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Srp54P14576 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Srp54P14576 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Srp54P14576 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Srp54P14576 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Srp54P14576 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Srp54P14576 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Srp54P14576 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Srp54P14576 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Srp54P14576 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Srp54P14576 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Srp54P14576 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Srp54P14576 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Srp54P14576 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Srp54P14576 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Srp54P14576 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Srp54P14576 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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