Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Vpreb1P13372 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Vpreb1P13372 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Vpreb1P13372 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Vpreb1P13372 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Vpreb1P13372 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Vpreb1P13372 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Vpreb1P13372 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Vpreb1P13372 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Vpreb1P13372 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Vpreb1P13372 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vpreb1P13372 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vpreb1P13372 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vpreb1P13372 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vpreb1P13372 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vpreb1P13372 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vpreb1P13372 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vpreb1P13372 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Vpreb1P13372 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vpreb1P13372 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vpreb1P13372 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vpreb1P13372 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vpreb1P13372 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vpreb1P13372 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vpreb1P13372 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vpreb1P13372 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vpreb1P13372 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vpreb1P13372 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vpreb1P13372 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Vpreb1P13372 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Vpreb1P13372 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Vpreb1P13372 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vpreb1P13372 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vpreb1P13372 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vpreb1P13372 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vpreb1P13372 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vpreb1P13372 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vpreb1P13372 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vpreb1P13372 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vpreb1P13372 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vpreb1P13372 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vpreb1P13372 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vpreb1P13372 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vpreb1P13372 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vpreb1P13372 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vpreb1P13372 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Vpreb1P13372 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vpreb1P13372 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vpreb1P13372 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vpreb1P13372 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vpreb1P13372 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vpreb1P13372 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vpreb1P13372 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vpreb1P13372 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vpreb1P13372 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vpreb1P13372 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vpreb1P13372 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vpreb1P13372 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vpreb1P13372 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vpreb1P13372 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vpreb1P13372 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vpreb1P13372 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vpreb1P13372 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vpreb1P13372 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vpreb1P13372 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vpreb1P13372 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vpreb1P13372 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vpreb1P13372 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vpreb1P13372 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vpreb1P13372 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Vpreb1P13372 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vpreb1P13372 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Vpreb1P13372 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vpreb1P13372 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vpreb1P13372 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vpreb1P13372 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vpreb1P13372 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vpreb1P13372 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vpreb1P13372 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vpreb1P13372 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vpreb1P13372 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vpreb1P13372 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vpreb1P13372 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vpreb1P13372 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vpreb1P13372 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vpreb1P13372 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vpreb1P13372 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vpreb1P13372 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vpreb1P13372 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vpreb1P13372 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vpreb1P13372 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vpreb1P13372 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vpreb1P13372 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vpreb1P13372 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vpreb1P13372 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vpreb1P13372 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vpreb1P13372 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vpreb1P13372 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vpreb1P13372 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vpreb1P13372 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms