Protein–RNA interactions for Protein: P13297

Msx1, Homeobox protein MSX-1, mousemouse

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Length 303 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx1P13297 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Msx1P13297 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Msx1P13297 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Msx1P13297 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Msx1P13297 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Msx1P13297 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Msx1P13297 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Msx1P13297 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Msx1P13297 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Msx1P13297 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Msx1P13297 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Msx1P13297 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Msx1P13297 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Msx1P13297 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Msx1P13297 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Msx1P13297 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Msx1P13297 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Msx1P13297 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Msx1P13297 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Msx1P13297 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Msx1P13297 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Msx1P13297 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Msx1P13297 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Msx1P13297 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Msx1P13297 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Msx1P13297 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Msx1P13297 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Msx1P13297 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Msx1P13297 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Msx1P13297 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Msx1P13297 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Msx1P13297 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Msx1P13297 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Msx1P13297 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Msx1P13297 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Msx1P13297 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Msx1P13297 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Msx1P13297 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Msx1P13297 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Msx1P13297 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Msx1P13297 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Msx1P13297 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Msx1P13297 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Msx1P13297 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Msx1P13297 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Msx1P13297 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Msx1P13297 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Msx1P13297 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Msx1P13297 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Msx1P13297 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Msx1P13297 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Msx1P13297 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Msx1P13297 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Msx1P13297 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Msx1P13297 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Msx1P13297 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Msx1P13297 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Msx1P13297 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Msx1P13297 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Msx1P13297 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Msx1P13297 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Msx1P13297 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Msx1P13297 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Msx1P13297 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Msx1P13297 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Msx1P13297 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Msx1P13297 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Msx1P13297 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Msx1P13297 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Msx1P13297 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Msx1P13297 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Msx1P13297 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Msx1P13297 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Msx1P13297 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Msx1P13297 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Msx1P13297 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Msx1P13297 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Msx1P13297 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Msx1P13297 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Msx1P13297 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Msx1P13297 Gm8369-204ENSMUST00000188633 1227 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Msx1P13297 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Msx1P13297 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Msx1P13297 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Msx1P13297 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Msx1P13297 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Msx1P13297 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Msx1P13297 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Msx1P13297 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Msx1P13297 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Msx1P13297 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Msx1P13297 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Msx1P13297 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Msx1P13297 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Msx1P13297 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Msx1P13297 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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