Protein–RNA interactions for Protein: P11531

Dmd, Dystrophin, mousemouse

Predictions only

Length 3,678 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DmdP11531 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DmdP11531 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DmdP11531 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DmdP11531 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DmdP11531 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DmdP11531 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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DmdP11531 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DmdP11531 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DmdP11531 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DmdP11531 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DmdP11531 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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DmdP11531 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DmdP11531 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DmdP11531 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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DmdP11531 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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DmdP11531 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DmdP11531 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DmdP11531 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DmdP11531 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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DmdP11531 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DmdP11531 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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DmdP11531 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
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DmdP11531 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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DmdP11531 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DmdP11531 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DmdP11531 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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DmdP11531 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
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DmdP11531 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
DmdP11531 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
DmdP11531 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DmdP11531 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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DmdP11531 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DmdP11531 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DmdP11531 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DmdP11531 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
DmdP11531 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
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DmdP11531 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
DmdP11531 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DmdP11531 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DmdP11531 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DmdP11531 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DmdP11531 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DmdP11531 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DmdP11531 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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