Protein–RNA interactions for Protein: P10628

Hoxd4, Homeobox protein Hox-D4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd4P10628 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Hoxd4P10628 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Hoxd4P10628 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Hoxd4P10628 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Hoxd4P10628 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Hoxd4P10628 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Hoxd4P10628 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Hoxd4P10628 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Hoxd4P10628 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Hoxd4P10628 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Hoxd4P10628 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Hoxd4P10628 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Hoxd4P10628 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Hoxd4P10628 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Hoxd4P10628 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Hoxd4P10628 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Hoxd4P10628 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Hoxd4P10628 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Hoxd4P10628 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Hoxd4P10628 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Hoxd4P10628 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Hoxd4P10628 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Hoxd4P10628 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Hoxd4P10628 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Hoxd4P10628 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Hoxd4P10628 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Hoxd4P10628 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Hoxd4P10628 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Hoxd4P10628 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Hoxd4P10628 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Hoxd4P10628 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Hoxd4P10628 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Hoxd4P10628 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Hoxd4P10628 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Hoxd4P10628 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Hoxd4P10628 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Hoxd4P10628 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Hoxd4P10628 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Hoxd4P10628 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Hoxd4P10628 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Hoxd4P10628 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Hoxd4P10628 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Hoxd4P10628 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Hoxd4P10628 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Hoxd4P10628 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Hoxd4P10628 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Hoxd4P10628 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Hoxd4P10628 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Hoxd4P10628 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Hoxd4P10628 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Hoxd4P10628 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Hoxd4P10628 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Hoxd4P10628 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Hoxd4P10628 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Hoxd4P10628 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Hoxd4P10628 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Hoxd4P10628 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Hoxd4P10628 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Hoxd4P10628 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Hoxd4P10628 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Hoxd4P10628 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Hoxd4P10628 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Hoxd4P10628 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Hoxd4P10628 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Hoxd4P10628 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Hoxd4P10628 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Hoxd4P10628 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.15
Hoxd4P10628 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Hoxd4P10628 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Hoxd4P10628 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Hoxd4P10628 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Hoxd4P10628 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Hoxd4P10628 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Hoxd4P10628 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Hoxd4P10628 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Hoxd4P10628 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Hoxd4P10628 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Hoxd4P10628 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Hoxd4P10628 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Hoxd4P10628 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Hoxd4P10628 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Hoxd4P10628 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Hoxd4P10628 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Hoxd4P10628 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Hoxd4P10628 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Hoxd4P10628 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Hoxd4P10628 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Hoxd4P10628 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Hoxd4P10628 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Hoxd4P10628 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Hoxd4P10628 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Hoxd4P10628 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Hoxd4P10628 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Hoxd4P10628 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Hoxd4P10628 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Hoxd4P10628 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Hoxd4P10628 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Hoxd4P10628 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Hoxd4P10628 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Hoxd4P10628 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.7 ms