Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P10404 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P10404 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P10404 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P10404 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P10404 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P10404 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P10404 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P10404 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
P10404 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P10404 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
P10404 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P10404 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P10404 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P10404 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P10404 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
P10404 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P10404 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P10404 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P10404 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
P10404 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P10404 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
P10404 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P10404 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
P10404 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P10404 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P10404 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P10404 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P10404 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
P10404 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
P10404 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P10404 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P10404 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P10404 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P10404 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P10404 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P10404 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
P10404 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P10404 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P10404 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P10404 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
P10404 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
P10404 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P10404 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P10404 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P10404 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P10404 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
P10404 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
P10404 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
P10404 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P10404 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P10404 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P10404 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
P10404 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P10404 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P10404 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
P10404 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
P10404 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P10404 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P10404 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
P10404 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
P10404 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
P10404 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
P10404 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
P10404 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
P10404 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
P10404 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
P10404 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
P10404 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
P10404 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
P10404 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
P10404 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
P10404 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
P10404 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
P10404 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
P10404 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
P10404 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
P10404 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
P10404 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
P10404 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
P10404 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
P10404 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
P10404 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
P10404 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
P10404 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
P10404 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
P10404 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
P10404 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
P10404 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P10404 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P10404 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
P10404 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
P10404 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P10404 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P10404 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P10404 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P10404 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
P10404 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P10404 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
P10404 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms