Protein–RNA interactions for Protein: P0DMN7

Amd1, S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme 1, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Amd1P0DMN7 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Amd1P0DMN7 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Amd1P0DMN7 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Amd1P0DMN7 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Amd1P0DMN7 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Amd1P0DMN7 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Amd1P0DMN7 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Amd1P0DMN7 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Amd1P0DMN7 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Amd1P0DMN7 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Amd1P0DMN7 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Amd1P0DMN7 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Amd1P0DMN7 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Amd1P0DMN7 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Amd1P0DMN7 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Amd1P0DMN7 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Amd1P0DMN7 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Amd1P0DMN7 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Amd1P0DMN7 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Amd1P0DMN7 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Amd1P0DMN7 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Amd1P0DMN7 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Amd1P0DMN7 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Amd1P0DMN7 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Amd1P0DMN7 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Amd1P0DMN7 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Amd1P0DMN7 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Amd1P0DMN7 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Amd1P0DMN7 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Amd1P0DMN7 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Amd1P0DMN7 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Amd1P0DMN7 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Amd1P0DMN7 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Amd1P0DMN7 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Amd1P0DMN7 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Amd1P0DMN7 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Amd1P0DMN7 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Amd1P0DMN7 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Amd1P0DMN7 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Amd1P0DMN7 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Amd1P0DMN7 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Amd1P0DMN7 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Amd1P0DMN7 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Amd1P0DMN7 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Amd1P0DMN7 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Amd1P0DMN7 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Amd1P0DMN7 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Amd1P0DMN7 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Amd1P0DMN7 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Amd1P0DMN7 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Amd1P0DMN7 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Amd1P0DMN7 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Amd1P0DMN7 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Amd1P0DMN7 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Amd1P0DMN7 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Amd1P0DMN7 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Amd1P0DMN7 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Amd1P0DMN7 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Amd1P0DMN7 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Amd1P0DMN7 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Amd1P0DMN7 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Amd1P0DMN7 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Amd1P0DMN7 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Amd1P0DMN7 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Amd1P0DMN7 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Amd1P0DMN7 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Amd1P0DMN7 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Amd1P0DMN7 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Amd1P0DMN7 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Amd1P0DMN7 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Amd1P0DMN7 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Amd1P0DMN7 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Amd1P0DMN7 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Amd1P0DMN7 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Amd1P0DMN7 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Amd1P0DMN7 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Amd1P0DMN7 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Amd1P0DMN7 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Amd1P0DMN7 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Amd1P0DMN7 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Amd1P0DMN7 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Amd1P0DMN7 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Amd1P0DMN7 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Amd1P0DMN7 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Amd1P0DMN7 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Amd1P0DMN7 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Amd1P0DMN7 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Amd1P0DMN7 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Amd1P0DMN7 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Amd1P0DMN7 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Amd1P0DMN7 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Amd1P0DMN7 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Amd1P0DMN7 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Amd1P0DMN7 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Amd1P0DMN7 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Amd1P0DMN7 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Amd1P0DMN7 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Amd1P0DMN7 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Amd1P0DMN7 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Amd1P0DMN7 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms