Protein–RNA interactions for Protein: P09925

Surf1, Surfeit locus protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Surf1P09925 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Surf1P09925 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Surf1P09925 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Surf1P09925 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Surf1P09925 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Surf1P09925 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Surf1P09925 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Surf1P09925 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Surf1P09925 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Surf1P09925 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Surf1P09925 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Surf1P09925 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Surf1P09925 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Surf1P09925 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Surf1P09925 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Surf1P09925 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Surf1P09925 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Surf1P09925 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Surf1P09925 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Surf1P09925 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Surf1P09925 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Surf1P09925 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Surf1P09925 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Surf1P09925 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Surf1P09925 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Surf1P09925 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Surf1P09925 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Surf1P09925 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Surf1P09925 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Surf1P09925 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Surf1P09925 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Surf1P09925 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Surf1P09925 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Surf1P09925 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Surf1P09925 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Surf1P09925 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Surf1P09925 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Surf1P09925 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Surf1P09925 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Surf1P09925 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Surf1P09925 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Surf1P09925 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Surf1P09925 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Surf1P09925 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Surf1P09925 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Surf1P09925 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Surf1P09925 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Surf1P09925 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Surf1P09925 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Surf1P09925 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Surf1P09925 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Surf1P09925 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Surf1P09925 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Surf1P09925 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Surf1P09925 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Surf1P09925 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Surf1P09925 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Surf1P09925 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Surf1P09925 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Surf1P09925 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Surf1P09925 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Surf1P09925 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Surf1P09925 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Surf1P09925 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Surf1P09925 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Surf1P09925 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Surf1P09925 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Surf1P09925 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Surf1P09925 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Surf1P09925 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Surf1P09925 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Surf1P09925 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Surf1P09925 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Surf1P09925 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Surf1P09925 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Surf1P09925 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Surf1P09925 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Surf1P09925 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Surf1P09925 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Surf1P09925 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Surf1P09925 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Surf1P09925 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Surf1P09925 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Surf1P09925 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Surf1P09925 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Surf1P09925 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Surf1P09925 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Surf1P09925 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Surf1P09925 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Surf1P09925 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Surf1P09925 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Surf1P09925 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Surf1P09925 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Surf1P09925 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Surf1P09925 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Surf1P09925 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Surf1P09925 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Surf1P09925 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Surf1P09925 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Surf1P09925 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms