Protein–RNA interactions for Protein: P09631

Hoxa9, Homeobox protein Hox-A9, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa9P09631 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxa9P09631 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxa9P09631 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxa9P09631 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxa9P09631 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxa9P09631 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxa9P09631 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxa9P09631 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxa9P09631 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxa9P09631 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxa9P09631 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxa9P09631 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxa9P09631 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxa9P09631 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxa9P09631 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxa9P09631 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxa9P09631 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxa9P09631 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxa9P09631 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxa9P09631 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxa9P09631 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxa9P09631 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxa9P09631 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxa9P09631 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Hoxa9P09631 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Hoxa9P09631 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Hoxa9P09631 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Hoxa9P09631 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Hoxa9P09631 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxa9P09631 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxa9P09631 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxa9P09631 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxa9P09631 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxa9P09631 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxa9P09631 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxa9P09631 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxa9P09631 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxa9P09631 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxa9P09631 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxa9P09631 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxa9P09631 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxa9P09631 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxa9P09631 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxa9P09631 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxa9P09631 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxa9P09631 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxa9P09631 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxa9P09631 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxa9P09631 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxa9P09631 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxa9P09631 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxa9P09631 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxa9P09631 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxa9P09631 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxa9P09631 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxa9P09631 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxa9P09631 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxa9P09631 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxa9P09631 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxa9P09631 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxa9P09631 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxa9P09631 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxa9P09631 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxa9P09631 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxa9P09631 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxa9P09631 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxa9P09631 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxa9P09631 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxa9P09631 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxa9P09631 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxa9P09631 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxa9P09631 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxa9P09631 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxa9P09631 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxa9P09631 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxa9P09631 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxa9P09631 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxa9P09631 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxa9P09631 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxa9P09631 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxa9P09631 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxa9P09631 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxa9P09631 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxa9P09631 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxa9P09631 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxa9P09631 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxa9P09631 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxa9P09631 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxa9P09631 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxa9P09631 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxa9P09631 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxa9P09631 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxa9P09631 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxa9P09631 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxa9P09631 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxa9P09631 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxa9P09631 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxa9P09631 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxa9P09631 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxa9P09631 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms