Protein–RNA interactions for Protein: P09055

Itgb1, Integrin beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb1P09055 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Itgb1P09055 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Itgb1P09055 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Itgb1P09055 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Itgb1P09055 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Itgb1P09055 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Itgb1P09055 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Itgb1P09055 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Itgb1P09055 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Itgb1P09055 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Itgb1P09055 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Itgb1P09055 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Itgb1P09055 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Itgb1P09055 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Itgb1P09055 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Itgb1P09055 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Itgb1P09055 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Itgb1P09055 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Itgb1P09055 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Itgb1P09055 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Itgb1P09055 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Itgb1P09055 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Itgb1P09055 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Itgb1P09055 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Itgb1P09055 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Itgb1P09055 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Itgb1P09055 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Itgb1P09055 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Itgb1P09055 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Itgb1P09055 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Itgb1P09055 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Itgb1P09055 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Itgb1P09055 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Itgb1P09055 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Itgb1P09055 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Itgb1P09055 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Itgb1P09055 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Itgb1P09055 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Itgb1P09055 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Itgb1P09055 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Itgb1P09055 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Itgb1P09055 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Itgb1P09055 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Itgb1P09055 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Itgb1P09055 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Itgb1P09055 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Itgb1P09055 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Itgb1P09055 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Itgb1P09055 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Itgb1P09055 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Itgb1P09055 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Itgb1P09055 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Itgb1P09055 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Itgb1P09055 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Itgb1P09055 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Itgb1P09055 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Itgb1P09055 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Itgb1P09055 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Itgb1P09055 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Itgb1P09055 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Itgb1P09055 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Itgb1P09055 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Itgb1P09055 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Itgb1P09055 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Itgb1P09055 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Itgb1P09055 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Itgb1P09055 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Itgb1P09055 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Itgb1P09055 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Itgb1P09055 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Itgb1P09055 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Itgb1P09055 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Itgb1P09055 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Itgb1P09055 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Itgb1P09055 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Itgb1P09055 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Itgb1P09055 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Itgb1P09055 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Itgb1P09055 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Itgb1P09055 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Itgb1P09055 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Itgb1P09055 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Itgb1P09055 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Itgb1P09055 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Itgb1P09055 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Itgb1P09055 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Itgb1P09055 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Itgb1P09055 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Itgb1P09055 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Itgb1P09055 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Itgb1P09055 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Itgb1P09055 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Itgb1P09055 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Itgb1P09055 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Itgb1P09055 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Itgb1P09055 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Itgb1P09055 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Itgb1P09055 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Itgb1P09055 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Itgb1P09055 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.3 ms