Protein–RNA interactions for Protein: P09025

Hoxc8, Homeobox protein Hox-C8, mousemouse

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc8P09025 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxc8P09025 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxc8P09025 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxc8P09025 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxc8P09025 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxc8P09025 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxc8P09025 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxc8P09025 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxc8P09025 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxc8P09025 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxc8P09025 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxc8P09025 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxc8P09025 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Hoxc8P09025 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Hoxc8P09025 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Hoxc8P09025 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Hoxc8P09025 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Hoxc8P09025 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxc8P09025 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxc8P09025 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxc8P09025 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxc8P09025 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxc8P09025 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxc8P09025 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxc8P09025 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxc8P09025 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxc8P09025 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxc8P09025 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxc8P09025 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxc8P09025 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxc8P09025 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxc8P09025 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxc8P09025 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxc8P09025 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxc8P09025 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxc8P09025 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxc8P09025 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxc8P09025 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxc8P09025 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxc8P09025 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxc8P09025 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxc8P09025 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxc8P09025 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxc8P09025 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxc8P09025 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxc8P09025 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxc8P09025 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxc8P09025 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxc8P09025 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxc8P09025 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxc8P09025 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxc8P09025 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxc8P09025 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxc8P09025 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxc8P09025 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxc8P09025 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxc8P09025 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxc8P09025 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxc8P09025 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxc8P09025 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxc8P09025 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxc8P09025 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxc8P09025 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxc8P09025 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxc8P09025 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxc8P09025 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxc8P09025 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxc8P09025 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxc8P09025 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxc8P09025 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxc8P09025 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxc8P09025 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxc8P09025 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxc8P09025 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxc8P09025 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxc8P09025 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxc8P09025 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxc8P09025 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxc8P09025 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxc8P09025 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxc8P09025 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxc8P09025 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxc8P09025 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxc8P09025 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxc8P09025 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxc8P09025 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxc8P09025 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxc8P09025 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxc8P09025 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxc8P09025 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxc8P09025 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxc8P09025 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxc8P09025 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxc8P09025 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxc8P09025 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxc8P09025 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxc8P09025 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxc8P09025 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxc8P09025 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxc8P09025 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms