Protein–RNA interactions for Protein: P09024

Hoxb7, Homeobox protein Hox-B7, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb7P09024 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Hoxb7P09024 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Hoxb7P09024 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Hoxb7P09024 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Hoxb7P09024 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Hoxb7P09024 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Hoxb7P09024 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Hoxb7P09024 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Hoxb7P09024 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Hoxb7P09024 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Hoxb7P09024 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Hoxb7P09024 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Hoxb7P09024 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Hoxb7P09024 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Hoxb7P09024 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hoxb7P09024 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hoxb7P09024 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hoxb7P09024 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hoxb7P09024 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hoxb7P09024 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hoxb7P09024 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hoxb7P09024 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hoxb7P09024 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hoxb7P09024 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hoxb7P09024 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hoxb7P09024 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hoxb7P09024 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hoxb7P09024 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hoxb7P09024 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hoxb7P09024 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hoxb7P09024 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hoxb7P09024 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hoxb7P09024 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hoxb7P09024 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Hoxb7P09024 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hoxb7P09024 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hoxb7P09024 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hoxb7P09024 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hoxb7P09024 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hoxb7P09024 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hoxb7P09024 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hoxb7P09024 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hoxb7P09024 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hoxb7P09024 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hoxb7P09024 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hoxb7P09024 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hoxb7P09024 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hoxb7P09024 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hoxb7P09024 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hoxb7P09024 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hoxb7P09024 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hoxb7P09024 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hoxb7P09024 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hoxb7P09024 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hoxb7P09024 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hoxb7P09024 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hoxb7P09024 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Hoxb7P09024 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hoxb7P09024 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hoxb7P09024 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hoxb7P09024 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hoxb7P09024 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hoxb7P09024 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hoxb7P09024 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hoxb7P09024 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hoxb7P09024 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hoxb7P09024 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hoxb7P09024 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hoxb7P09024 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hoxb7P09024 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hoxb7P09024 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hoxb7P09024 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hoxb7P09024 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hoxb7P09024 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hoxb7P09024 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Hoxb7P09024 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hoxb7P09024 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hoxb7P09024 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Hoxb7P09024 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hoxb7P09024 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hoxb7P09024 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hoxb7P09024 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hoxb7P09024 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hoxb7P09024 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hoxb7P09024 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hoxb7P09024 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hoxb7P09024 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hoxb7P09024 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hoxb7P09024 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Hoxb7P09024 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hoxb7P09024 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hoxb7P09024 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hoxb7P09024 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hoxb7P09024 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hoxb7P09024 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hoxb7P09024 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hoxb7P09024 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hoxb7P09024 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hoxb7P09024 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hoxb7P09024 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms