Protein–RNA interactions for Protein: P07309

Ttr, Transthyretin, mousemouse

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Length 147 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtrP07309 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
TtrP07309 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
TtrP07309 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
TtrP07309 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
TtrP07309 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
TtrP07309 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
TtrP07309 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
TtrP07309 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
TtrP07309 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
TtrP07309 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
TtrP07309 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
TtrP07309 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
TtrP07309 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
TtrP07309 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
TtrP07309 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
TtrP07309 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
TtrP07309 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
TtrP07309 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
TtrP07309 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
TtrP07309 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
TtrP07309 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
TtrP07309 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
TtrP07309 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
TtrP07309 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
TtrP07309 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
TtrP07309 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
TtrP07309 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
TtrP07309 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
TtrP07309 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
TtrP07309 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
TtrP07309 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
TtrP07309 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
TtrP07309 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
TtrP07309 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
TtrP07309 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
TtrP07309 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
TtrP07309 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
TtrP07309 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
TtrP07309 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
TtrP07309 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
TtrP07309 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
TtrP07309 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
TtrP07309 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
TtrP07309 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
TtrP07309 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
TtrP07309 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
TtrP07309 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
TtrP07309 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
TtrP07309 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
TtrP07309 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
TtrP07309 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
TtrP07309 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
TtrP07309 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
TtrP07309 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
TtrP07309 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
TtrP07309 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
TtrP07309 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
TtrP07309 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
TtrP07309 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
TtrP07309 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
TtrP07309 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
TtrP07309 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
TtrP07309 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
TtrP07309 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
TtrP07309 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
TtrP07309 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
TtrP07309 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
TtrP07309 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
TtrP07309 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
TtrP07309 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
TtrP07309 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
TtrP07309 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
TtrP07309 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
TtrP07309 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
TtrP07309 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
TtrP07309 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
TtrP07309 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
TtrP07309 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
TtrP07309 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
TtrP07309 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
TtrP07309 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
TtrP07309 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
TtrP07309 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
TtrP07309 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
TtrP07309 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
TtrP07309 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
TtrP07309 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
TtrP07309 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
TtrP07309 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
TtrP07309 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
TtrP07309 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
TtrP07309 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
TtrP07309 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
TtrP07309 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
TtrP07309 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
TtrP07309 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
TtrP07309 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
TtrP07309 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
TtrP07309 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
TtrP07309 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
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