Protein–RNA interactions for Protein: P06336

Ig epsilon chain C region, mousemouse

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Length 421 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06336 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
P06336 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
P06336 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P06336 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P06336 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P06336 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
P06336 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P06336 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
P06336 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
P06336 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P06336 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P06336 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P06336 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P06336 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P06336 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P06336 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
P06336 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
P06336 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P06336 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P06336 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
P06336 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P06336 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
P06336 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
P06336 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P06336 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P06336 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P06336 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P06336 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P06336 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P06336 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P06336 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
P06336 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P06336 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P06336 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
P06336 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P06336 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P06336 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P06336 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
P06336 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
P06336 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
P06336 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
P06336 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
P06336 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
P06336 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
P06336 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
P06336 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
P06336 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
P06336 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
P06336 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
P06336 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
P06336 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
P06336 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
P06336 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
P06336 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
P06336 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
P06336 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
P06336 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
P06336 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
P06336 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
P06336 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
P06336 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
P06336 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
P06336 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
P06336 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
P06336 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
P06336 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
P06336 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
P06336 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
P06336 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
P06336 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
P06336 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
P06336 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
P06336 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
P06336 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
P06336 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
P06336 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
P06336 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
P06336 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
P06336 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
P06336 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
P06336 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
P06336 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
P06336 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
P06336 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
P06336 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
P06336 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
P06336 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
P06336 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
P06336 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
P06336 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
P06336 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
P06336 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
P06336 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
P06336 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
P06336 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
P06336 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
P06336 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
P06336 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
P06336 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
P06336 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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