Protein–RNA interactions for Protein: P06320

T-cell receptor beta chain V region CTL-F3, mousemouse

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06320 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P06320 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P06320 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P06320 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P06320 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
P06320 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
P06320 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P06320 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P06320 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P06320 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P06320 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P06320 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
P06320 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P06320 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P06320 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P06320 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P06320 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P06320 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P06320 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P06320 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P06320 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
P06320 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
P06320 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P06320 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P06320 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P06320 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
P06320 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
P06320 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
P06320 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P06320 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
P06320 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P06320 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P06320 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P06320 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P06320 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P06320 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC10□□□□□ -0.81
P06320 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
P06320 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P06320 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P06320 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P06320 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
P06320 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
P06320 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P06320 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P06320 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P06320 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
P06320 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P06320 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P06320 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P06320 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
P06320 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P06320 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
P06320 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
P06320 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
P06320 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
P06320 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P06320 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P06320 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
P06320 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P06320 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
P06320 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P06320 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P06320 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P06320 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P06320 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P06320 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P06320 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P06320 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P06320 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P06320 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P06320 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P06320 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
P06320 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P06320 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P06320 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
P06320 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P06320 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
P06320 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
P06320 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P06320 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P06320 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
P06320 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
P06320 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
P06320 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P06320 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P06320 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P06320 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P06320 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P06320 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P06320 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P06320 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
P06320 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P06320 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P06320 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P06320 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P06320 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P06320 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P06320 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P06320 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P06320 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms