Protein–RNA interactions for Protein: P04213

T-cell receptor beta chain V region C5 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04213 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P04213 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P04213 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
P04213 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P04213 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P04213 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P04213 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
P04213 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
P04213 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
P04213 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P04213 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P04213 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
P04213 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P04213 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P04213 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
P04213 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P04213 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P04213 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P04213 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P04213 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
P04213 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P04213 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P04213 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
P04213 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P04213 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P04213 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P04213 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P04213 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P04213 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P04213 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
P04213 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
P04213 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
P04213 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
P04213 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
P04213 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
P04213 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P04213 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P04213 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P04213 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P04213 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P04213 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P04213 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P04213 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P04213 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P04213 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
P04213 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P04213 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P04213 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P04213 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
P04213 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P04213 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P04213 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P04213 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P04213 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P04213 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
P04213 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P04213 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
P04213 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
P04213 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P04213 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P04213 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P04213 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
P04213 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P04213 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P04213 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
P04213 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P04213 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P04213 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P04213 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
P04213 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P04213 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P04213 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P04213 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P04213 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P04213 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P04213 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
P04213 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P04213 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P04213 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P04213 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P04213 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P04213 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
P04213 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P04213 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P04213 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
P04213 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P04213 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P04213 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P04213 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P04213 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
P04213 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P04213 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
P04213 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
P04213 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P04213 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P04213 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P04213 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P04213 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P04213 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P04213 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms