Protein–RNA interactions for Protein: P01810

Ig heavy chain V region J539, mousemouse

Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01810 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01810 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01810 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01810 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01810 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01810 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01810 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01810 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01810 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01810 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01810 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01810 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01810 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01810 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
P01810 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01810 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01810 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01810 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01810 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01810 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01810 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
P01810 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01810 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
P01810 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
P01810 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01810 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01810 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01810 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01810 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01810 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01810 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01810 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01810 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01810 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01810 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
P01810 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01810 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01810 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01810 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01810 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01810 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01810 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01810 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01810 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01810 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
P01810 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01810 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01810 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01810 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01810 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01810 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01810 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01810 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01810 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01810 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01810 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01810 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01810 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01810 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01810 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
P01810 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
P01810 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
P01810 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
P01810 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01810 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01810 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01810 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01810 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01810 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01810 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01810 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01810 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01810 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01810 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01810 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01810 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01810 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01810 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01810 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01810 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01810 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01810 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01810 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01810 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01810 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
P01810 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01810 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01810 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01810 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
P01810 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01810 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01810 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01810 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01810 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01810 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01810 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01810 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01810 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01810 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01810 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms